长链非编码RNA在多发性硬化中的研究

来源 :天津医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:connine_li
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目的:长链非编码RNA在调节免疫功能方面起到重要的作用。然而这些长链非编码RNA在慢性炎性疾病,如多发性硬化中的作用机制尚不完全清楚。因此在多发性硬化病人的外周血单个核细胞中,我们检测了长链非编码RNA的表达谱,以及它们可能发挥的作用。方法:在这个研究当中,我们按照McDonald criteria诊断标准入组了26个多发性硬化患者。在这26个多发性硬化患者当中,我们随机选择6个作基因芯片高通量检测。基因芯片检测技术识别出具有表达差异的长链非编码RNA,然后我们应用实时定量PCR技术对所检测的RNA进行验证。我们应用Gene Ontology(GO)和相关性分析的方法对长链非编码RNA进行注释,使用Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(KEGG)的方法,对长链非编码RNA富集的通路进行分析。并且使用“cis”和“trans”的模型对长链非编码RNA和编码RNA之间的调控关系进行阐述。结果:与健康对照的外周血单个核细胞相比,在多发性硬化患者中,我们检测到了2353条表达上调的长链非编码RNA,389条下调的长链非编码RNA,1037条上调的mRNA以及279条下调的mRNA(大于2倍)。并且用实时定量PCR技术验证的6条差异长链非编码RNA的趋势与芯片检测结果是一致的。共表达网络由864条长链非编码RNA和628条mRNA组成。在所有的长链非编码RNA中,有10条被预测有10个cis调控的目标基因。有33条长链非编码RNA可能调控它们的trans目标基因。结论:在这个研究当中,我们识别了一系列具有表达差异的长链非编码RNA和mRNA。具有表达差异的长链非编码RNA可能在多发性硬化的病理过程中起到一定的作用。然而在多发性硬化发病的过程当中,长链非编码RNA所发挥的具体作用,以及生物学功能尚不清楚,需要进一步研究。目的:在这个研究中,我们主要致力于揭示linc-MAF-4在多发性硬化的病理过程中所起的作用。方法:我们按照改良的Mc Donald多发性硬化诊断标准入组了34个多发性硬化病人。随机抽取6个多发性硬化病人和5个健康对照,分别留取它们的外周血单个核细胞做基因芯片分析。通过在初始CD4~+ T细胞中敲低或者是过表达linc-MAF-4来分析CD4~+ T细胞的亚群变化。结果:基因芯片结果显示,和健康对照相比,多发性硬化患者的外周血单个核细胞中linc-MAF-4明显增多。另外,在多发性硬化中linc-MAF-4可以调节Th1细胞的分化。以腺病毒转染的方式向多发性硬化患者初始CD4~+ T细胞中转染合成的linc-MAF-4,可以通过抑制转录因子MAF促进Th1细胞的分化,抑制Th2细胞的分化(MAF为Th2细胞的转录因子)。在多发性硬化中Linc-MAF-4促进了CD4~+ T细胞的激活。linc-MAF-4的表达水平与多发性硬化的年复发率是相关的。结论:我们的结果显示linc-MAF-4参与到了多发性硬化的病例机制中,尤其是通过调节T细胞的分化起作用。许多自身免疫性疾病,如多发性硬化,都和Th17细胞的分化密切相关。然而,Th17细胞参与自身免疫的具体机制尚不清楚。在该研究中,我们发现DDIT4和其相关的长链非编码RNA(lnc DDIT4)可以抑制Th17细胞的分化。我们入组了36个多发性硬化病人。其中6个多发性硬化病人和5个健康对照提供外周血单个核细胞行基因芯片分析。基因芯片数据分析表明和健康对照相比,lnc DDIT4和DDIT4 m RNA在多发性硬化患者中具有表达差异性。我们用实时定量PCR对其进行了验证。然后我们对初始CD4~+ T细胞的lnc DDIT4和DDIT4 m RNA进行干预,并对Th17细胞进行观察。多发性硬化患者lnc DDIT4和DDIT4 m RNA的表达水平无论在外周血单个核细胞还是CD4~+ T细胞都比健康对照高。DDIT4m RNA(和健康对照相比,在多发性硬化患者中有2.79倍上调)是lnc DDIT4(在多发性硬化中有4.32倍上调)的cis调控靶基因。刺激初始CD4~+ T细胞使其向Th17方向分化,我们观察到lnc DDIT4和DDIT4 m RNA的表达增多。然而在刺激初始CD4~+ T细胞使其向Th1,Th2,Treg的方向分化时,lnc DDIT4和DDIT4 m RNA的表达水平无明显变化。在初始CD4~+ T细胞中过表达lnc DDIT4,可以通过增加DDIT4,激活DDIT4/m TOR通路来抑制IL-17的转录。类似的,在初始CD4~+ T细胞中降低lnc DDIT4的表达,可以通过激活DDIT4/m TOR通路来促进Th17的分化。然而当DDIT4被沉默以后,这些变化消失。这些结果表明lnc DDIT4通过直接作用于DDIT4影响着Th17的分化。
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