随着社会的不断发展和改革的深入进行,科学技术作为知识最有效的利用手段,在我们社会生活中发挥着越来越重要的作用。科技投入产出则成为衡量各国各地区科技发展的一项较为直观的指标,特别是R&D经费投入成为促进科技事业发展的重要支撑条件。因此,开展各地区R&D经费的研究,对保证地区科技与社会的持续、稳定、协调发展有着重大意义。本文首先对世界上,特别是工业发达国家的R&D投入发展过程及现状进行了定性分析,并与我国的一些基本指标进行了对比研究。提出了用数据包络分析方法客观评价地区科技投入产出有效性问题的思想。对数据包络分析的理论及应用进行了系统的研究和介绍。在理论研究方面,介绍了数据包络分析的C2R模型、C2GS2模型和MDEA模型的建立过程,阐明了模型的经济意义。在应用研究方面,对应用数据包络分析的具体方法、决策单元有效性的评估进行了研究。在利用历史数据的基础上,本文对重庆市R&D经费投入的现状进行了全面分析,并运用C2R模型、C2GS2模型以及MDEA模型对选取的全国28个省、直辖市为实证分析对象来评价各地区2001年～2003年的科技投入产出的技术有效性、规模有效性,计算出各地区的MDEA效率值并进行了排序,对模型结果进行了分析;建立了重庆市全社会R&D经费投入对GDP增长的经济计量模型和全社会R&D经费投入与GDP比值的经济计量模型,分析了模型结果。通过对全国科技投入产出和重庆市R&D经费投入的深入研究,构建了科技投入产出相对有效性评价的完整理论体系,并将其运用于重庆市R&D经费投入评价过程中。针对重庆市R&D经费投入现状,提出了相应的对策建议。