随着中央大部制改革的基本完成,地方政府机构改革已经在各地陆续展开。群众对地方政府改革的关注度越来越高。同时,二十世纪90年代以来,业务流程再造成为管理界的热门话题。将业务流程再造,运用于地方政府机构改革,就是针对地方政府机构的核心职能,重新设计流程,基于此流程进行同步的组织变革。本文希望对地方政府机构改革进行分析,通过定性分析与定量分析相结合的研究方法。在地方政府机构改革领域引入BPR流程再造理论,对地方政府机构进行基于流程的组织变革。对地方政府机构运用BPR理论的可行性和具体方法进行了探讨。并探讨了支撑基于BPR流程再造理论的地方政府机构改革后的相应对策,在任务分配时,采用整数规划模型的方式进行合理分配；实现政府部门的最优化配置,并运用整数规划模型对变革前后的效果进行评估。通过多元化操作,增加融资渠道,实行KPI绩效考核等多种方式来配合流程的运行。以达到顺利实现地方政府机构核心职能的目的。