基于COI和ND5序列的中国南方唇(鱼骨)和间(鱼骨)种群遗传变异与亲缘地理分析

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唇(鱼骨)(Hemibarbus labeo)和间(鳕)(Hemibarbus medius)是(鱼骨)属的两个常见种,隶属于鲤形目(Cypriniformes)、鲤科(Cyprinidae)、鮈亚科(Gobioninae)。其中唇(鱼骨)广泛分布于黑龙江至长江以南地区,间(鱼骨)分布于华南及西南部分地区。由于二者在形态上极为相似,主要鉴别特征存在交叉重叠,且分布记述上存在着分歧,因此,它们的物种有效性有待澄清。  本文对采自海南岛水系、珠江水系、长江水系和东南沿海几条水系,共8个唇(鲳)种群和9个间(鲳)种群的细胞色素c氧化酶亚基Ⅰ(COI)基因和NADH脱氢酶亚基5(ND5)基因序列片段进行了测定,结合这两个基因进行组合序列分析,探讨了唇鳕和间(鱼骨)的群体遗传变异和亲缘地理关系。主要结果如下:  1.通过对17条水系唇(鱼骨)种群和间(鱼骨)种群的130条COI基因和ND5基因组合序列的分析,发现共有196个核苷酸变异位点(占全序列的9.11%),共有50个单倍型。单倍型多样性为0.964,核苷酸多样性为0.01895,遗传多样性较高。  2.基于COI基因和ND5基因组合序列构建的NJ树,MP树、ML树和贝叶斯树的结果基本一致。根据贝叶斯树结果显示,所有种群可分为两支,其中支系Ⅰ可分成A和B两个姐妹群,其中A群包含海南岛三条水系,漠阳江,贺江信江,北江、钱塘江、东江种群的所有单倍型和桂江、闽江、瓯江、湘江、柳江的部分单倍型。B群包含了沅江种群的全部单倍型和桂江、湘江、柳江、闽江种群的部分单倍型,A群又可以分为A1和A2两个姐妹群,A1群可分成两支(A1-1,A1-2):一支包含了北江、贺江种群的全部单倍型和东江、柳江、桂江、湘江种群的部分单倍型。另外一支则包含了海南岛三条水系和漠阳江种群的所有单倍型。A2群包含了钱塘江、信江种群的全部单倍型和瓯江、闽江、东江种群的部分单倍型。支系Ⅱ则包含了韩江和九龙江的全部单倍型以及瓯江的部分单倍型。  3.单倍型网络图结果表明,韩江、九龙江种群和其他水系种群分化较大;海南岛这一地理区间种群的单倍型分支与代表珠江水系单倍型的分支之间的亲缘关系较近,与其他地理区间种群的亲缘关系则较远,而漠阳江的种群则是从海南岛水系向北扩散至漠阳江水系的。湘江种群和桂江及柳江种群共享单倍型。  4.根据地理分布特征及线粒体DNA谱系,划分为5个地理区,AMOVA结果显示,地理区域间的遗传变异所占百分比较大,种群间形成明显的系统地理结构。而错配分析和中性检验均显示,唇(鲳)种群和间(鲳)种群均没有发生过扩张。  5.根据系统发育物种概念,我们认为分布于华南及西南部分地区的间(鱼骨)不能独立构成单系群,不是一个有效物种。而韩江与九龙江种群独立构成单系群,且这两个种群之间的遗传距离小于与其它种群的遗传距离,故认为这两个种群与其他种群可分为不同种。
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