行政协议是一种特殊的行政行为,不同于具体行政行为,也不同于民事行为。2015年新的《行政诉讼法》的修改施行表明了我国行政协议制度的确立,对我国市场经济的发展起着积极的推动作用。通过研究发现,目前我国对于行政协议的界定还没有统一的标准,行政协议在行政行为体系中也很难找到合适的归属,搞清楚这一问题是解决行政协议纠纷的前提和必要条件。当行政协议运用到现实生活中时会仍然会出现一系列的纠纷,这时我们会发现我国法律规定行政协议的救济并不十分完善。在诉讼解决争议的方式中,我们受案范围过于模糊使得有些行政协议的纷争被排除在外。在实践中很多法官将行政协议案件纳入民事诉讼程序中是十分不合理的。目前我国行政协议制度主要存在受案范围难以把握、效力审查依据存在争议、溯及力规定新旧法衔接存在争议、行政机关无起诉权、举证责任具有单向性问题、行政协议能否仲裁无定论、行政协议能否复议无定论等问题。文章通过对学界的观点进行了梳理和分析,对最新的实践案例仔细剖析当前存在的问题,并结合域外的相关研究,希望探寻得到行政协议纠纷的解决之道。