HIV/AIDS湿热内蕴证炎症基因及其通路的研究

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目的:运用基因芯片技术对受试者的清晨空腹外周血进行转录组学研究,筛选HIV/AIDS湿热内蕴证患者的差异基因(mRNA),对差异mRNA进行基因本体功能分类,找到参与炎症反应的特异mRNA,运用定量PCR技术,验证HIV/AIDS湿热内蕴证炎症反应的特异mRNA,研究炎症反应的发病机制。构建参与HIV/AIDS湿热内蕴证炎症反应的基因分子网络,为HIV/AIDS中医证型客观化和疗效评价提供研究基础,完善转录组学研究技术平台,为中医证候的研究提供可行方法。方法:1实验所用样本来自河南某地区,采用2011年国家卫生部颁发的西医诊断标准《艾滋病诊疗指南》,采用导师组前期课题国家自然科学基金“艾滋病中医证候分布规律及证候标准建立与验证”(编号:90409004),研究成果“HIV/AIDS湿热内蕴证诊断量表”为HIV/AIDS湿热内蕴证候诊断标准。2使用Agilent公司的单标表达谱芯片,运用Agilent Feature Extraction(FE)software version 9.5.3提取数据,产生“txt”格式文件,运用SAS在线分析系统分析,应用独立样本T检验进行差异mRNA筛选,得到基因表达关系。3运用DAVID(http://david.abcc.ncifcrf.gov/)在线分析对差异mRNA的本体功能进行注释和分类;运用STRING(http://string.embl.de)对差异mRNA功能的相互关系进行分析,运用KEGG_PATHWAY数据库库对差异mRNA的通路进行分析。4运用定量PCR技术,对目的基因进行相对定量分析,验证参与HIV/AIDS湿热内蕴证炎症反应的特异mRNA。结果:1共纳入研究对象40例,其中HIV/AIDS湿热内蕴证患者24例,同地区健康人16例,两组在年龄、性别组成上没有显著差异;CD4+水平上湿热内蕴组低于健康对照组,结果具有显著差异;CD8+水平湿热内蕴组高于健康对照组,结果具有显著差异。2运用spss21.0软件,对两组间的mRNA进行t检验分析,并结合变化倍数值FC≥2或FC≤0.5,得到两者的差异mRNA177条,根据DAVID功能注释得到三方面内容:参与的生物过程(Biological Process,BP)、分子功能(Molecular Function,MF)、细胞组分(Cellular Component,CC),其中参与生物过程的种类有77类,其中参与inflammatory response(炎症反应)的有9个:CCL3↓,UNC13D↓,CR2↓,DARC↓,CCL3L3↓,IL6R↑,C2↓,PTAFR↑,AHSG↓,主要与inflammatory response,response to wounding,defense response,immune response,leukocyte mediated immunity,chemotaxi等功能相关。3通过STRING(http://string.embl.de)得到35个边组成的基因相互关系图;通过KEGG_PATHWAY通路分析,得出通路19个。主要有Staphylococcus aureus infection(金黄葡萄菌感染),Hematopoietic cell lineage(造血细胞系),Cytokine-cytokine receptor interaction(细胞因子受体互动),Toll-like receptor signaling pathway(Toll受体信号通路),Salmonella infection(沙门氏菌感染),Chemokine signaling pathway(趋化因子信号通路),Rheumatoid arthritis(类风湿性关节炎),Complement and coagulation cascades(补体和凝集源)。4运用定量PCR技术验证得到Ct值,在湿热内蕴组与健康对照组Ct值的相对定量比较中,IL6R、CCL3与C2基因表达上调,其中IL6R变化趋势与芯片结果一致,CCL3和C2基因变化趋势与芯片结果不一致。结论:1基因芯片技术能够得到HIV/AIDS湿热内蕴证与健康对照组的差异mRNA表达谱,以便后续研究使用,有利于对中医证候生物学基础进行研究。2对差异基因进行本体功能分类,得出参与炎症反应的基因有9条,主要与炎症反应,外伤反应,防御反应,免疫反应,趋化作用等功能相关,与湿热内蕴证的炎症反应机制关系密切。3对差异mRNA涉及的Chemokine signaling pathway(趋化因子信号通路),Toll-like receptor signaling pathway(toll样受体信号通路),Complement and coagulation cascades(补体系统及凝血级联通路)进行理论探讨,这些通路可能参与湿热内蕴证炎症反应。4补体系统及凝血级联通路与HIV/AIDS湿热内蕴证的关系密切,补体系统的激活能够激活肥大细胞,释放组胺,引起血管扩张和通透性增加,这些与湿热内蕴证的常见临床症状关系密切,可能与艾滋病湿热内蕴证的炎症反应机制相关。
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