家族性急性髓系白血病相关新基因(FAMLF)全长cDNA的克隆及其功能的初步预测

来源 :福建医科大学 | 被引量 : 1次 | 上传用户:ruoxich
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白血病是血液系统最常见的恶性肿瘤,白血病的发生发展与其相关基因结构及功能的异常密切相关,克隆白血病相关新基因有助于深入阐述白血病发生发展的分子生物学机制,为白血病的诊断和治疗奠定基础。【目的】克隆家族性急性髓系白血病相关新基因cDNA全长,在分子水平上探讨急性白血病发生发展的机制。【方法】应用抑制性消减性杂交( suppression subtractive hybridization ,SSH)构建家族性急性髓系白血病cDNA抑制性消减文库,获得28个基因克隆,测序后经GenBank同源对比分析,发现11条为未知基因的EST片断,以其中的一条未知新EST zywB-87(GenBank注册号:CV973101)为基础: 1、应用一步法逆转录PCR(OneStep RT-PCR)验证其差异表达;2、应用SMART -cDNA末端快速扩增法(SMART -rapid amplification of cDNA ends, SMART -RACE)克隆家族性急性髓系白血病相关新基因的全长cDNA;3、应用生物信息学方法对家族性急性髓系白血病相关新基因的功能进行初步分析。【结果】获得了家族性急性髓系白血病相关新基因全长cDNA,该基因定位于染色体1q31.3,cDNA全长2313bp ,开放读码框(open reading frame,ORF)为249bp,编码82个氨基酸的蛋白质,Blast检索为功能未知的新基因,已被GenBank收录,并被命名为FAMLF,核酸注册号为EF413001,蛋白质注册号为ABN58747。【结论】1、成功获得家族性急性髓系白血病相关新基因FAMLF的cDNA全长,染色体定位于1q31.3,编码82个氨基酸的蛋白质。2、FAMLF是一个功能未知的新基因。3、SMART-RACE技术是克隆新基因cDNA全长的有效方法。4、生物信息学分析可初步预测新基因FAMLF的功能。
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