中国经济的快速发展，给城镇化进程提供了充足的动力，但经济的快速增长主要依靠外延扩张，是基于对城市边缘区耕地资源的占用。本文所研究的农村土地流转指的是城镇化建设中的农村土地流转，主要是指土地资源从农业用地变更为城市建设用地的过程，是资源重新分配和利用的过程。面对越来越严重的农村土地城市化，为了追求最大的经济效益和社会效益，必须提高土地生产效率和配置效率，尽最大可能减少农村土地资源的损失，对于单个区域或整个社会的经济可持续发展具有积极而重要的意义。本文从农村土地流转配置效率的角度,以生产前沿面理论作为理论依据,采用数据包络分析方法对不同研究区域的农村土地流转配置效率进行比较全面的分析，主要研究内容有两方面：一是为实现资源最优配置，研究如何使资源与效益的投入产出比最小化，分别对资源配置在不同经济条件下的表现形式进行分析，对土地资源市场配置和政府配置的特点进行对比。二是分析制度环境对农村土地流转配置效率的影响。在DEA模型的基础上，将收集来的真实数据作为研究对象，对农村土地流转配置效率受到的制度环境影响进行实证分析，并根据分析结果提出提高农村土地流转配置效率的建议。经过分析研究，本文得到结论是:制度环境变量对农村土地流转配置效率有显著影响，不考虑制度环境因素的影响，具有制度优势地区的效率会被高估，而处于制度劣势地区的效率会被低估。在本文中，对技术效率的实证分析采用三阶段DEA模型，选择影响农村土地流转配置效率但不在主观可控范围内的因素，侧重考虑对农村土地流转配置效率有影响的制度环境变量。测算得出制度环境变量对各地区技术效率具有显著影响，经环境变量调整后的各地区技术效率水平显著下降，其中西部地区下降幅度最大，说明制度环境变迁将有利于对西部地区技术效率的进一步改善，其作用也最为显著。1999-2008年间，区域间流转技术效率差异明显，东部的技术效率水平最高，其次为中部地区，最后为西部地区；纯技术效率差异不显著,东部的纯技术效率水平最高,其次为西部地区和中部地区；区域间流转的规模效率差异显著，东部地区的规模效率值显著大于中、西部地区，但三大区域的效率值都有很大的提升空间，都未达到最优规模。