盐渍环境中优势菌群分析及分离菌株Q1U~T、Q1R~T和BZ1~T的多相分类研究

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本文介绍了细菌分类学研究的概况和盐单胞菌属、噬嘌呤菌属及芽胞杆菌属的分类学研究进展。对采自中国内蒙和青海土样中的细菌进行了选择性分离研究,对分离得到的细菌分离株进行了16S rRNA基因序列测定,并进行优势菌群分析和多相分类研究。本文首先使用不同的选择性培养基对土样中的细菌进行了分离,然后对分离株进行基于16S rRNA基因序列的系统发育分析,从而获取可培养细菌的多样性信息。基于16S rRNA基因序列的系统发育分析表明,盐渍环境中可培养的细菌种群多样性非常丰富,40个代表菌株分属于细菌域的3个门(厚壁菌门、放线菌门、变形菌门)、12个科、15个属。其中多数菌株属于厚壁菌门(Firmicutes),优势属为芽胞杆菌属(Bacillus)(17株,占总菌株的42.5%)。三株编号为Q1UT,Q1RT和BZ1T的细菌与其亲缘关系最近种的序列相似性分别为98.34%、97.95%、98.28%,初步确定为新种,并对其进行多相分类研究。研究结果表明,菌株Q1UT为革兰氏阴性好氧杆菌,菌落颜色为土黄色,生长NaCl浓度范围为0-20%(w/v)(最适7.5%),生长温度范围为2-37℃(最适30-33℃),生长pH范围为6.0-9.0(最适7.0);主要的呼吸醌类型为Q-9;菌株Q1RT为革兰氏阴性菌,菌落颜色为乳白色,生长NaCl浓度范围为0-9%(w/v)(最适2.5%),生长温度范围为2-38℃(最适30℃),生长pH范围为5.0-9.0(最适8.0);菌株BZ1T为革兰氏阳性好氧杆菌,菌落颜色为土黄色,生长NaCl浓度范围为0-5.5%(w/v)(最适0.5%),生长温度范围为6-40℃(最适30-33℃),生长pH范围为6.0-9.0(最适7.0);主要的呼吸醌类型为MK-7;主要的脂肪酸成分为iso-C15:0、anteiso-C15:0和iso-C14:0;极性脂成分为双磷脂酰甘油、磷脂酰甘油和磷脂酰乙醇胺。综合形态学特征、生理生化特性、化学分类和分子分类的多相分类研究结果,均支持三个菌株为新种,菌株Q1UT命名为泥色盐单胞菌(Halomonas lutescens sp.nov.),菌株Q1RT命名为微白噬嘌呤菌(Prolinoborus albatus sp.nov.),菌株BZ1T命名为扁平芽胞杆菌(Bacillus depressus sp.nov.)。
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