西藏芜菁遗传多样性分析与初级核心种质的构建

来源 :浙江大学 | 被引量 : 1次 | 上传用户:hzqifeng
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芜菁作为西藏少数能够成为高原特色产业的重要经济作物之一,是西藏地区一种传统的药用、食用和饲用作物,其栽培历史悠久,分化类型多样。由于青藏高原特殊的地理环境条件使得西藏芜菁地方品种丰富,具有较高的遗传多样性。然而,近年来由于自治区全面启动国家生态保护工程,随着整体搬迁聚居以及城镇化进程的显著加快,现代农业生产方式和农牧民的生活方式发生了巨大的改变。虽然芜菁种植面积有所扩大,但目前藏区广大农牧民已在一定规模上开始使用芜菁的F1杂交种子。众所周知,由于利用了杂种优势,杂交种在产量、品质和抗性上普遍优于常规品种,大面积使用杂交种将造成西藏芜菁的地方的常规品种急剧减少,从而导致种质资源的遗传多样性不断遭到破坏甚至丧失。因此,目前亟需对西藏地区的芜菁地方品种开展抢救性的搜集和保护工作。此外,研究表明,在芸薹属亚种中芜菁拥有最多的抗根肿病相关的基因资源,通过杂交和回交等育种方式可将抗性基因聚合在骨干亲本中,从而选育出抗根肿病的新品种。且由于根肿病原菌的侵染过程与寄主间是相互作用并选择的,因此,选育高抗根肿病品种也是最有效的防治根肿病的措施,并可由此开展芸薹属作物抗性种质的创新研究工作。本研究利用形态学标记与SSR分子标记技术对青藏高原芜菁种质资源的遗传多样性进行分析,探讨不同地理区域芜菁种质间的亲缘关系和遗传结构;构建芜菁初级种质资源库,为今后芜菁品种的改良与种质保存提供了基础材料与依据。同时,对上述抢救性搜集获得的种质资源进行了根肿病的抗性鉴定。取得了以下研究结果:(1)利用形态学标记对芜菁种质资源进行遗传多样性分析。本研究共测定了58个地上部和地下部形态性状,包括33个数量性状和25个质量性状。结果发现,质量性状中叶型、叶面蜡粉、叶脉鲜明度、叶脉光泽度、子叶颜色、根肩形状、侧芽萌发历、抽薹性在所有个体中相似性高达97%以上,变异系数较小,遗传多样性也较差,但侧根分布、叶柄颜色、叶柄横切面形状、叶缘波状、产品熟性、下胚轴颜色、根肩疤痕、根地下部皮色遗传多样性则较为丰富。在数量性状中,叶柄长、单株重、根重、肉质根横径、肉质根纵径、根地上部纵径间的遗传变异也较丰富。通过相关性分析发现单株重与子叶长、株高、株幅、叶片数、叶片长、叶片宽、叶柄宽、肉质根横径、雌蕊宽度、肉质根位置、叶顶端形状也表现正相关,而根重与株幅宽、株幅长、叶片数、肉质根横径、肉质根纵径、根地上部纵径、叶面、肉质根位置、叶裂刻、产品熟性表现不同程度的正相关,由此,我们可进行高产品种的早期筛选工作。聚类分析结果将171份芜菁种质分为一大一小2大类群,西藏地区的大部分品种聚为一个类群,认为类群划分与其地理来源存在一定关系,但不完全相符。(2)利用SSR分子标记技术对芜菁种质资源进行遗传多样性分析、亲缘关系鉴定及种群结构分析。本研究通过初步筛选获得31对多态性较好的SSR引物,利用其对171份芜菁材料进行扩增,共扩增出181条条带,其中,多态性条带163条,共性带18条,多态率高达90.1%。利用NTSYS 2.10e软件对31对引物产生的181份标记进行分析,得到芜菁材料间的遗传相似性系数。材料间的遗传变异很大,整个171份材料的遗传距离在0.12~1.09之间,遗传相似系数在0.73~0.95之间。通过NTSYS 2.10e及PowerMarker V3.25软件依据遗传相似系数矩阵,采用UPGMA聚类分析方法对171份材料进行聚类分析,发现在GS为0.73时,将171份种质分为两组。利用Structure软件对扩增结果进行群体结构分析,也将种质分为2个主要的类群。利用Past软件进行主成分分析,主成分1和主成分2分别能解释9%和5.3%的分子遗传变异,PCA图将171份芜菁种质资源划分为两块,分析结果与群体结构分析、聚类图结果一致。(3)构建了西藏芜菁的初级核心种质。本研究通过比较20%、15%、10%的不同总体取样规模下比较其均值差异百分率、方差差异百分率、极差符合率和变异系数变化率值来对初级核心种质资源的代表性进行评价。发现在总体取样比例为15%时,MD值较小,且VD、CR、和VR较大,说明该取样比例代表性较好。采用主成分分析法和相关性分析利用表型数据对构建的初级核心种质进行确认。比较初级核心种质和原始种质的主成分分析,发现初级核心种质的特征值、贡献率和累计贡献率都大于原始群体。各自的前8个主成分,特征值都大于2,第1个主成分的特征值分别为10.10和5.32,贡献率分别是21%和14%,前8个主成分的累积贡献率分别是75%和57%,表明初级核心种质的构建能够排除遗传冗余,使得累积贡献率明显提高。(4)对西藏芜菁种质资源开展根肿病抗性鉴定。本研究利用病土发病法对171份芜菁种质资源进行根肿病抗性鉴定观察记录各个植株根部的生长状况、发病情况并对芜菁根肿病的病情进行分级。发现在24份高抗品种中,有10份来自西藏,5份来自日本,4份来自中国除西藏外的其他省份,同时来自欧洲的4份ECD系列全部表现高抗根肿病,来自韩国的大白菜也表现高抗性,但来自中国的大白菜品种均表现为感病,上述根肿病抗性种质可为芸薹属根肿病的抗病育种研究提供新的抗源及研究思路。
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