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本试验根据GenBank上已发表的牛(NW001502197)和狗(NC006612)RAB27A基因序列设计引物,扩增山羊RAB27A基因从内含子1至外显子6部分序列片断,测序总长度为11483bp,已提交到GenBank,序列号为EU595665。为比较不同物种RAB27A基因分化程度,也同时测定了绵羊RAB27A基因部分序列,测序总长度为4728bp,已提交到GenBank,序列号为:EU599576。根据测序结果发现了山羊RAB27A基因序列上的33个突变,其中处于外显子的有2个,UTR的5个,内含子的26个。依据序列号EU595665上的位置来命名这些突变位点,处于外显子上的2个突变分别为183C>T和9669C>A,其中引起蛋白质的氨基酸序列的改变的点突变只有1个,是9669C>A(Leu180Met)。处于UTR和内含子的31个点突变分别为147G>A、9967T>C、10101G>A、10459G>C、10483C>A、523T>C、571T>C、699T>C、2306G>A、2426A>T、2428T>G、2719C>T、3338A>T、3636T>C、3660G>A、3817A>C、3907G>C、4165A>G、4440G>A、4492C>T、4634A>T、4708C>T、5198C>A、5300C>T、5686G>A、6472T>C、6754T>C、8127C>G、8316G>A、8778T>C和8930C>T。同时发现山羊RAB27A基因序列存在缺失、插入和替代的现象,缺失现象为第2772位缺失一个腺嘌呤(A)、第5109位缺失一个胸腺吡啶(T)和第4238-4252位缺失一个15bp的核苷酸片段(TTTTGTAACTATTTT);发生的插入现象是第4440位插入两个碱基(AG);发生的替代现象是第10325-10330位一个6bp核苷酸片段(AAAACA)被一个3bp核苷酸片段(CAA)替代。147G>A位点上检测到G和A两个等位基因。我们研究的8个山羊品种(承德无角山羊、雷州黑山羊、成都麻羊、南江黄羊快长系和黑色系、济宁青山羊、辽宁绒山羊和唐山奶山羊1333个个体中G为优势等位基因(90.39%),突变率在不同品种中存在差异。8个群体的GG基因型频率都比较高(63.83-97.37%),AG基因型频率在各群体间差异较大(2.63-31.91%),AA基因型仅在雷州山羊、南江黄羊(快长系和黑色系)等三个品种中出现。对8个地方山羊群体RAB27A基因147G>A位点进行的Hardy—Weinberg平衡检验结果表明,雷州山羊和南江黄羊黑色系未处于Hardy-Weinberg平衡状态(P<0.05),其余6个山羊群体均处于平衡状态,认为这6个山羊群体RAB27A基因147G>A位点上均未进行人工选择,遵循随机交配模式。同时这两个山羊群体的皮毛颜色都是黑色,这就说明山羊RAB27A基因147G>A位点可能与山羊的黑色毛色有关。山羊RAB27A基因9669C>A位点检测到C和A两个等位基因,通过对多态位点9669C>A群体分析,证实9669C>A是一个稀有突变。总体来说,不同物种RAB27A基因CDS序列变异度不大,以山羊的RAB27A基因CDS序列为参考,于其他物种的核苷酸一致性分别为绵羊99.40%、牛98.04%、马92.94%、猪92.79%、狗91.44%、大猩猩90.69%、人90.39%、恒河猴89.79%、小鼠86.94%、挪威鼠85.44%、短尾负鼠86.49%、鸡81.38%和非洲爪蛙80.63%。各物种间RAB27A基因CDS的聚类接过与动物分类学分法基本一致。