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本试验根据GenBank上已发表的牛（NW001502197）和狗（NC006612）RAB27A基因序列设计引物,扩增山羊RAB27A基因从内含子1至外显子6部分序列片断,测序总长度为11483bp,已提交到GenBank,序列号为EU595665。为比较不同物种RAB27A基因分化程度,也同时测定了绵羊RAB27A基因部分序列,测序总长度为4728bp,已提交到GenBank,序列号为:EU599576。根据测序结果发现了山羊RAB27A基因序列上的33个突变,其中处于外显子的有2个,UTR的5个,内含子的26个。依据序列号EU595665上的位置来命名这些突变位点,处于外显子上的2个突变分别为183C＞T和9669C＞A,其中引起蛋白质的氨基酸序列的改变的点突变只有1个,是9669C＞A（Leu180Met）。处于UTR和内含子的31个点突变分别为147G＞A、9967T＞C、10101G＞A、10459G＞C、10483C＞A、523T＞C、571T＞C、699T＞C、2306G＞A、2426A＞T、2428T＞G、2719C＞T、3338A＞T、3636T＞C、3660G＞A、3817A＞C、3907G＞C、4165A＞G、4440G＞A、4492C＞T、4634A＞T、4708C＞T、5198C＞A、5300C＞T、5686G＞A、6472T＞C、6754T＞C、8127C＞G、8316G＞A、8778T＞C和8930C＞T。同时发现山羊RAB27A基因序列存在缺失、插入和替代的现象,缺失现象为第2772位缺失一个腺嘌呤（A）、第5109位缺失一个胸腺吡啶（T）和第4238-4252位缺失一个15bp的核苷酸片段（TTTTGTAACTATTTT）;发生的插入现象是第4440位插入两个碱基（AG）;发生的替代现象是第10325-10330位一个6bp核苷酸片段（AAAACA）被一个3bp核苷酸片段（CAA）替代。147G＞A位点上检测到G和A两个等位基因。我们研究的8个山羊品种(承德无角山羊、雷州黑山羊、成都麻羊、南江黄羊快长系和黑色系、济宁青山羊、辽宁绒山羊和唐山奶山羊1333个个体中G为优势等位基因（90.39%）,突变率在不同品种中存在差异。8个群体的GG基因型频率都比较高（63.83-97.37%）,AG基因型频率在各群体间差异较大（2.63-31.91%）,AA基因型仅在雷州山羊、南江黄羊（快长系和黑色系）等三个品种中出现。对8个地方山羊群体RAB27A基因147G＞A位点进行的Hardy—Weinberg平衡检验结果表明,雷州山羊和南江黄羊黑色系未处于Hardy-Weinberg平衡状态（P＜0.05）,其余6个山羊群体均处于平衡状态,认为这6个山羊群体RAB27A基因147G＞A位点上均未进行人工选择,遵循随机交配模式。同时这两个山羊群体的皮毛颜色都是黑色,这就说明山羊RAB27A基因147G＞A位点可能与山羊的黑色毛色有关。山羊RAB27A基因9669C＞A位点检测到C和A两个等位基因,通过对多态位点9669C＞A群体分析,证实9669C＞A是一个稀有突变。总体来说,不同物种RAB27A基因CDS序列变异度不大,以山羊的RAB27A基因CDS序列为参考,于其他物种的核苷酸一致性分别为绵羊99.40%、牛98.04%、马92.94%、猪92.79%、狗91.44%、大猩猩90.69%、人90.39%、恒河猴89.79%、小鼠86.94%、挪威鼠85.44%、短尾负鼠86.49%、鸡81.38%和非洲爪蛙80.63%。各物种间RAB27A基因CDS的聚类接过与动物分类学分法基本一致。