基于FSRAP标记的四倍体小麦遗传图谱构建及株高与其相关性状QTL定位

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小麦是重要的粮食作物。部分小麦品种易倒伏、抗病虫害能力弱,限制了粮食的生产,难以满足人类的需求。矮秆小麦具有抗倒伏、抗病虫害、耐干旱、耐盐碱地、提高收获指数等优点,因而具有育种潜力。“绿色革命”以来,由于矮秆小麦和矮秆基因的利用,世界范围内小麦产量大幅度提升。目前共发现25个Rht矮秆基因(Rht1~Rht25),仅有Rht1、Rht2和Rht8被广泛应用于育种实践。可见,矮秆基因利用十分欠缺,矮秆小麦资源仍然不足,特别是籽粒营养价值较高的四倍体矮秆小麦,在实际育种中应用较少。因此,寻找新的矮秆资源,鉴定新的矮源基因,加强现有矮源和矮秆基因的研究是必要的工作。硬粒小麦ANW16G携带矮秆基因Rht18,是重要的四倍体矮秆资源。目前关于ANW16G的研究利用较少。为加强四倍体矮秆小麦的研究和应用,开发具有育种价值的矮秆基因,本研究将矮秆小麦ANW16G和高秆小麦LD222进行杂交,共获得210株F2群体,对F2群体株高及各茎节间长度进行主基因+多基因数量遗传分析,绘制基于FSRAP标记和SSR标记的遗传图谱并进行QTL定位,主要结果如下:1、F2群体的株高及各茎节间长均呈连续的偏正态分布,株高与各节间长呈极显著正相关,与倒一节间长相关性最高。株高由2个主效基因控制,表现为加性-显性-上位性遗传模型,各茎节间长都是由1个主效基因控制的加性-显性遗传模型。2、利用亲本筛选1936对FSRAP引物,一共筛选出170对多态性明显,稳定性高的引物。每对引物检测的多态性位点在1~6个之间,少数引物能够检测到约10个多态性位点,一共检测到245个多态性位点。使用亲本筛选397对小麦SSR引物,其中87对SSR引物在亲本间具有明显差异,每对引物检测到的多态性位点在1~3个之间。3、绘制了一张全长为1860.2cM的四倍体矮秆小麦遗传图谱,包含14个连锁群(Group1~Group14),其中7个连锁群(Group1~Group7)分布于1A、2A、3A、4A、5B、6A、6B染色体上,另外7个连锁群(Group8~Group14)未能定位染色体。遗传图谱一共锚定146个标记,包括138个FSRAP标记和8个SSR标记,标记间平均遗传距离为12.7cM,Group6连锁群上标记数最多,有28个,总遗传距离203.8cM,标记间平均遗传距离7.2cM,被定位到6A染色体上。Group4连锁群的总遗传距离最长,为285.8cM,含14个标记,标记间平均遗传距离为20.4cM,被定位到4A染色体上。4、共检测到30个控制株高及各茎间长遗传效应的QTL,分布于1A、3A、4A、6A和6B染色体上,其中4个为主效QTL。控制株高的QTL有9个,包括1个主效QTL,LOD值范围在3.01~5.55之间,分布在1A、3A、4A和6A染色体上。同样有9个QTL控制倒一节间长的遗传效应,分别分布在1A、3A、6A和6B染色体上,LOD值范围在3.03~6.45之间,其中2个为主效QTL。控制倒二节间长的QTL有1个,被定位到1A染色体上,LOD值是4.03。控制倒三节间长的QTL有5个,其中1个是主效QTL,LOD值在3.17~5.03之间,分布于染色体1A、3A和4A上。有4个QTL控制倒四节间长,LOD值在3.39~3.55之间,也分布于染色体1A、3A和4A上。有2个QTL控制倒五茎节间长度,LOD值为3.22~3.65,分布在3A染色体上。所有QTL遗传效应都为加性效应,且大多QTL表现为负向增效,表明这些QTL主要来源于矮秆亲本ANW16G,控制株高降低,1A和3A染色体上出现了QTL富集。
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