河流生态系统是地球上最为复杂的生态系统之一。近年来,河流生态学中最具活力的领域之一就是生态系统健康研究,如何评价河流生态状况正成为河流生态学领域的研究热点和最具突破的领域之一。此外,我国水环境管理将逐渐从水质管理向水生态健康管理的模式转变,科学评价河流生态系统的健康状态将是我国水生态健康管理的重要基础。本研究应用浮游植物多样性指数评价了我国清水型河流赣江的大型支流-袁河的水质状况,同时应用鱼类完整性指数法评价了该流域的水生态系统完整性,最终应用综合指标法评价了袁河水生态系统的健康状态。这对于较为深入了解袁河水生态系统的受损现状与把握袁河水生态系统结构与功能可能变化的趋势具有重要意义,最终将为袁河的生态修复、水资源的合理开发利用、流域的可持续发展决策和水生态健康管理提供重要的科学依据和有益借鉴。本论文的主要研究内容和取得的成果如下：(1)袁河水生生物调查共发现浮游植物6门61属109种,其中以硅藻门、绿藻门和蓝藻门的物种为主；丰水期和枯水期蓝藻丰度占优势,平水期硅藻丰度占绝对优势；所识别出的优势种钝脆杆藻、小席藻、尖尾蓝隐藻、双头针杆藻、梅尼小环藻等均为污染水体的指示物种；选用浮游植物多样性指数法和浮游植物群落指示法两种方法来评价了袁河水质现状,评价结果基本一致,发现袁河整体处于α-β-中污染状态。(2)袁河水生生物调查共发现鱼类3目19科(亚科)46种。其中,以鲤科鱼类物种为主,而未发现入侵种；并识别出鲫、鲤、鲢、鳙、银鮈、赤眼鳟和黄颡鱼等鱼类占优势；从群落营养级组成来看,以处于次级消费者营养级的鱼类类群、杂食性及处于分解者的食碎屑鱼类物种为主,而处于初级消费者和顶级消费者营养级的鱼类类群物种数相对较低；从鱼类物种耐污性来看,袁河流域所发现鱼类物种以耐污种占优势,敏感种和中等耐污鱼类物种处于次优势地位,而极度耐污和极度敏感鱼类物种极少；在调查中未发现明显畸形和严重病菌感染的鱼类；运用鱼类完整性指数法评价了袁河水生态系统完整性,结果表明,整体处于差-一般的水平。(3)基于层次分析法构建了包括河流水文特征、河流形态特征、河岸带植被现状、河流水质污染指标以及河流的水生生物群落特征指标在内的综合指标体系,并评价了袁河的水生态系统健康状态。研究结果表明,袁河整体上处于亚健康的状态。