青海湖盐单胞菌的分离及四氢嘧啶合成基因簇的克隆表达

来源 :华中师范大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:guocheng2244
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
嗜盐菌是指在高盐环境中生存的微生物的总称。在长期的进化过程中,嗜盐和耐盐微生物主要通过两种机制来维持细胞和周围环境的渗透压平衡,防止细胞脱水而裂解死亡,包括细胞质积累无机离子的方式和有机相容性溶质的机制。嗜盐古菌和极端嗜盐菌主要采用细胞内积累K+和Cl-的策略来平衡外界的渗透压,中度嗜盐菌则主要是细胞内积累相容性溶质的机制来抵御高盐环境。其中,四氢嘧啶是好氧的中度嗜盐菌中分布最广泛的相容性溶质。由于四氢嘧啶能作为细胞的保护剂、酶的稳定剂和DNA、蛋白质等生物大分子的保护剂,帮助细胞抵抗高温、冷冻、干燥、高盐、辐射和氧自由基等逆境,因此四氢嘧啶在酶制剂、PCR稳定剂、化妆品、精细化工和制药行业有广泛的应用前景而倍受关注。四氢嘧啶合成基因簇ectABC已经在很多种属中成功克隆鉴定,从分子水平上研究嗜盐菌耐盐调控的分子机制,将耐盐基因片段转入植物中,构建抗旱的基因工程菌株和作物新品种,对于改善我国盐碱旱的土壤具有重要的意义。同时将耐盐的基因工程菌株用于高盐有机废水的生物治理,具有重要的经济利用价值。本研究从青海湖20份水样中利用RM高盐选择性培养基筛选得到35株嗜盐菌,选取其中一株优势中度嗜盐菌QHL1作为进一步研究的材料。形态学和生理生化特征研究结果表明:QHL1菌落呈规则圆形、土黄色、透明、中心突出、边缘光滑、形态居中。显微形态呈短杆状,单个或者成串排列,革兰氏染色阴性。菌株QHL1能利用果糖、蔗糖、葡萄糖、麦芽糖、酵母抽提物、蛋白胨、铵盐、尿素和硝酸盐作为碳氮源,不能利用蜜二糖、松三糖、木糖醇和亚硝酸钠。甲基红试验、明胶试验、吲哚试验等重要检测指标均为阴性,氧化酶试验阳性、不产H2S、嗜盐性试验阳性。生长特性研究结果显示:QHL1的生长盐度为0.04-2.74 mol/L,最适生长盐度为0.86 mol/L;生长温度为10~45℃,最适生长温度为37℃;生长pH为4.5-10,最适生长pH为8.5。16S rDNA分子鉴定结果显示:嗜盐菌QHL1的16S rDNA大小为1420bp, BLAST比对分析,菌株QHL1与Halomonas sp. TNB158 (No. AB166899)相似性最高,达到99%。通过形态学、生长特性和生理生化特征结合16S rDNA的鉴定结果,初步认定菌株QHL1属于盐单胞菌属(Halomonas)。利用薄层层析(TLC)和高效液相色谱(HPLC)对嗜盐菌QHL1胞内的四氢嘧啶的含量进行定性和定量的测定,其中薄层层析结果显示Rf为0.31,与四氢嘧啶标准品一致,说明QHL1是一株积聚四氢嘧啶的盐单胞菌。高效液相色谱结果显示嗜盐菌QHL1胞内的四氢嘧啶含量约为269.9μg/mL。设计保守基因ectB的引物,以嗜盐菌QHL1的基因组DNA为模板,PCR扩增获得ectB基因。根据已知的ectB基因序列分别设计三条同向的特异性引物,运用染色体步移技术克隆得到四氢嘧啶合成基因簇ectABC及其侧翼序列。DNAStar软件对克隆得到的序列进行ORF分析,结果表明有3个开放阅读框,且ectA、 ectB和ectC位于同一个操纵子上,大小分别为579bp、1269bp和390bp,预测分别编码192、422和129个氨基酸的肽链;同源性分析其分别与Halomonas sp. Nj223 ectABC基因簇所编码的二氨基丁酸转乙酰基酶(EctA)、二氨基丁酸转氨酶(EctB)和四氢嘧啶合成酶(EctC)的相似性达57%、96%和85%。在线软件预测了ectABC上游可能的启动子序列和位置。利用分子克隆技术将ectB基因亚克隆至表达载体pET-28a中,构建重组表达载体pET-ectB,通过限制性酶切和测序分析,目的基因的大小、插入位置和读码框均正确,未发生错配和移码。将重组表达载体pET-ectB转入E. coli BL21(DE3)中,筛选得到阳性重组菌;在IPTG的诱导下,表达产物经SDS-PAGE分析发现,成功表达出一条特异性的46kDa目的蛋白条带。
其他文献
短细胞是玉米等禾本科植物特化的表皮细胞,包括栓质细胞和硅质细胞两种,成熟的栓质细胞是一种细胞壁栓质化的活细胞,而硅质细胞是充满硅质体的死细胞。在不同植物或同一植物
中国是世界第一产煤大国,也是煤炭消费大国,煤炭已经成为了国民经济发展的重要基础。煤矿煤仓是煤炭运输的关键环节,目前传统的清仓方式仍为人工清仓,其危险性高,人员劳动强度大,且煤仓内部的有毒气体是一个难以解决的难题。因此,本文提出采用机器人代替人工的新型清理方式,并对煤仓清堵机器人的机械结构、力学特性和轨迹规划等进入了深入的研究。煤仓清堵机器人的出现实现了机械化,自动化清仓,提高了清仓安全性和工作效率
诱导多潜能干细胞(induced Pluripotent Stem cells,iPS)和ES细胞(Embryonic Stem cell,ES)一样具有分化形成三个胚层的细胞的潜能。由于iPS细胞的应用不存在ES细胞所面临的
全球干旱区域的面积在日益扩大且程度日趋加重,这严重的制约着农业科技的发展。现今大多数农作物因其长期生长在较优裕的条件下,其抗旱性的遗传潜力极其有限,然而,一些荒漠旱
URO基因属于植物特有的C2H2基因家族,是可以调控植物体内内源生长素动态平衡的转录调控因子。本实验室前期研究结果表明,在拟南芥中,URO基因过量表达可以使植物体内的自由态
斑布蚋Simulium(Byssodon)maculatum(Meigen,1804)是世界性分布的医学昆虫的一个重要昆虫,它可以传播多种疾病,对居民生活造成许多困扰,被认为是新疆额尔齐斯河流域的主要害
在研究油菜素内酯的信号通路和合成途径过程中,遗传突变体发挥了很重要的作用。早期被鉴定到的大多数突变体表型都比较明显,比如植株极端矮化、雄性不育等,因此这些强突变体
植物程序性细胞死亡(PCD)指植物细胞在生长发育过程中,由自身基因编码的、主动的、有序的细胞死亡过程,参与植物正常发育与抵抗环境胁迫。GAAP是定位于高尔基体和内质网上的B
表观遗传学是研究不涉及DNA序列改变的可遗传表现型改变的一门学科。DNA甲基化是表观遗传调控的重要机制之一,在胚胎发育早期,DNA甲基化模式的建立主要是由DNMT3A/B来完成,而
催乳素释放肽(PrRP)可以结合G蛋白偶联受体中的孤儿受体GPR10,因其可以促进催乳素释放,故命名为催乳素释放肽。自1998年发现之日起,对于PrRP的功能研究报道有超过150篇文献,P