为了深入研究南海北部不同季风期间海洋环境变化对生态系统中浮游植物群落结构的影响，根据国家908专项ST08区块于2006年7月14日-8月12日（夏季）、2006年12月18日-2007年1月20日（冬季）不同季风时期在南海西北部陆架区(17.43°-21.43°N、109.48°-113.23°E)两个航次的调查资料，对微型浮游植物群落结构特征进行分析，并结合调查海域的环境因子，应用多元统计方法，重点分析浮游植物群落时空变化特征及环境因子对其的影响，探讨微型浮游植物群落对调查海域中尺度物理过程的响应。　　 调查海区夏季、冬季气候差异明显。夏季盛行西南季风，气温较高;冬季盛行东北季风，气温较低。水温分布总的态势是近岸低外海高，等温线走向与等深线大体平行。夏季，在西南季风影响下，海南岛东岸形成上升流，呈现低温、高盐、高营养盐特征。雷州半岛近岸由于粤西沿岸流及外侧风生海流作用，形成低温的冷涡，引发底层水上升，加上珠江径流携带，海水硝酸盐、磷酸盐、硅酸盐等浓度高。冬季，在东北季风剧烈作用下，水体混合强烈，近岸浅水区季节性温盐跃层消失，温度、盐度、营养盐等呈垂直均匀状态，水层之间差异不明显。由于没有上升流作用，硝酸盐、磷酸盐浓度低于夏季。　　 夏季和冬季共鉴定浮游植物365种，其中硅藻228种，甲藻124种，蓝藻8种，金藻3种、绿藻2种。夏季浮游植物种类数（311种）比冬季（281种）高。种类数水平分布中，夏季各水层种类数由近岸到外海种类数减少，而冬季在调查海域中部种类数较高。垂直分布上，重点调查断面，夏季浮游植物由近岸到外海种数减少，并且随深度增加;冬季浮游植物种数从近岸到外海，表层到底层种类数均呈现低-高-低的趋势。　　 夏季和冬季微型浮游植物细胞密度和分布有明显的季节差异，夏季0m、10m、30m层细胞密度分别为234.23×102cells/L，434.87×102cells/L，262.72×102cells/L;冬季三个层次浮游植物细胞密度分别为80.40×102cells/L，70.06×102cells/L，73.80×102cells/L。夏季浮游植物细胞密度高值区主要分布在粤西近海、琼州海峡东口以及海南岛东部沿岸，外海密度较低;垂直分布上，在10m层细胞密度较其它水层要高，尤其在冷涡覆盖海域。冬季细胞密度高值区出现在外海，近岸低，垂直分布较均匀。　　 调查海域微型浮游植物优势种夏季主要以热带、亚热带沿岸种为主，冬季外海大洋种占一定的优势。优美伪菱形藻（Pseudonitzschiadelicatissima）和菱形海线藻（Thalassionemanitzschioides）是夏季和冬季4个水层皆出现的优势种;拟旋链角毛藻（Chaetocerospseudocurvisetus）在夏季占优势，冬季不占优势;优美辐杆藻（Bacteriastrumdelicatulum）和新月筒柱藻（Cylindrothecaclosterium）是冬季优势种;劳氏角毛藻（Chaetoceroslorenzianus）在夏季0m层以及冬季四个水层中都是优势种，中肋骨条藻（Skeletonemacostatum）在夏季和冬季某些水层占优势。　　 夏季在西南季风驱动下，调查海区物理-化学-生物耦合作用明显，浮游植物群落结构对中尺度物理过程响应迅速，表现在粤西冷涡和琼东上升流中心区的浮游植物种类数、细胞密度、硅甲藻比以及多样性都较边缘区以及外海高。冬季在东北季风强烈搅动下，水体混合均匀，浮游植物各项群落结构特征参数差别小。物种-环境CCA分析结果证实南海北部夏、冬季不同环境因子是造成浮游植物群落结构差异的原因。