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牛病毒性腹泻（Bovine viral diarrhea，BVD）是由牛病毒性腹泻病毒（BVDV）引起的多症状、多宿主为特征的一种重要传染病。由该病毒世界性广泛存在，引起的牛源生物制品的污染、持续感染造成巨大的经济损失越来越引起人们的重视。
应用RT-PCR方法从BVDV新疆石河子分离株、玛纳斯不同年份两个分离株扩增获得3株BVDV E2基因的序列，分别命名Shihezi 148、Manasi和MNS2（GenBank登录号：EU159699、EU159703和EU169937）。测序结果表明，3株E2基因长度分别为1121bp、1122bp和1122bp，分别编码373、374和374个氨基酸残基。核酸序列同源性和系统发生分析表明，3株病毒均属于BVDV基因1型（BVDV-1），Shihezi 148株与澳大利亚Bega株亲缘关系最近，E2蛋白氨基酸同源性为90.11％，同处于BVDV-1c基因亚型群。Manasi株和MNS2株E2基因核酸序列仅有4个碱基的差别，它们与Changchun184和匈牙利VEDEVAC株亲缘关系最近，Manasi和MNS2株与Changchun184株E2氨基酸同源性分别高达98.66％和98.93％，位于BVDV-1b基因亚型群。
将BVDV Shihezi 148株的E2基因亚克隆到pProEX HTa和pVAX1载体中，构建得到了去除C端跨膜区E2基因的原核表达质粒pProEX HTa-E2和包括信号肽和全长E2蛋白的真核重组质粒pVAX1-E2；经过PCR、酶切及测序表明，成功构建pProEX HTa-E2和pVAX1-E2重组表达质粒。将重组质粒pProEXHTa-E2分别转化大肠杆菌DH5a、JM109和BL21（DE3），IPTG诱导表达，SDS-PAGE检测，结果表明目的蛋白没有表达。
对Manasi E2序列分析及应用软件预测，以pET-28a为载体构建了含有E2蛋白不同抗原表位（7-124）-（148-345）-（98-312）-（7-345）的pET-（7-124）、pET-（148-345）、pET-（98-312）、pET-（7-345）四个重组质粒，转化大肠杆菌并诱导目的蛋白的表达，SDS-PAGE电泳检测结果显示，这四个重组质粒在大肠杆菌中得到了良好的表达，所表达的融合蛋白相对分子量分别为18.6KDa、28.2KDa、29.2KDa、43.8KDa，与预计蛋白分子量一致。Western blot分析结果表明，pET-（148-345）、pET-（98-312）、pET-（7-345）重组质粒所表达的融合蛋白能被牛抗BVDV阳性血清识别，提示表达的这三种重组蛋白均具有良好的反应原性，这为下一步用重组蛋白建立检测BVDV抗体的间接ELISA法，奠定了良好的基础。