TIM-4基因多态性与中国汉族人群哮喘的相关性研究

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支气管哮喘是由多种炎症细胞(如嗜酸性粒细胞、肥大细胞和T淋巴细胞)及细胞因子参与的气道慢性炎症性疾病,以Th1/Th2平衡失调为主要特征。一般认为哮喘属于Th2型免疫反应,存在向Th2细胞的免疫偏离。功能上与细胞的诱导及分化相关的基因可能通过影响细胞的诱导与分化进而引发或者促进了Th1/Th2平衡失调节并在哮喘发生中发挥作用,因此这一类基因是很重要的哮喘候选基因。最近的研究发现人类TIM(T cell immunoglobulin domain and mucin domain)家族成员可能在CD4+T细胞的分化与增殖中起作用,是一类可以影响Th1/Th2平衡的基因。2001年,McIntire在对转基因小鼠哮喘易感基因的研究过程中发现一个可以调节T细胞与气道反应性的基因座位Tapr(T cell and Airway phenotypeRegulator)并在这一基因座位上克隆到了一个新的小鼠基因家族即Tim基因家族,进而发现Tim-1与Tim-3基因多态位点与小鼠气道高反应性高度相关。TIM基因家族编码一类T细胞表面具有共同基序的Ⅰ型跨膜糖蛋白,基本结构包括信号肽、免疫球蛋白区、粘蛋白区、跨膜区和带有磷酸化位点的胞内区。人类的同源基因TIM基因家族位于被多次证明与支气管哮喘连锁的5q33.2区域,包括三个成员TIM-1,TIM-3和TIM-4,功能上均可能与Th1/Th2平衡调节有关。自TIM基因家族发现以来,对该基因家族成员在不同人群中与哮喘进行的相关性研究成为热点。我们的前期研究结果表明位于TIM-1基因上游调控区域的一个功能性SNP与汉族人群哮喘具有相关性,TIM-4作为TIM-1的一个天然配体,而且TIM-1与TIM-4的相互作用在T细胞的增殖中具有重要的作用,那么TIM-4是否在哮喘的发生中也具有作用呢?对此,我们利用病例对照关联分析进行了研究。利用HapMap数据库,我们从TIM-4基因内选择了3个罕见等位基因频率(Minoallele frequency,MAF)较高的SNP位点,分别是位于启动子区域的rs6882076 A/G,位于内含子1的rs12658558 G/A,以及位于内含子2的rs4704727 G/T,选择rs6882076的依据是该位点有可能通过影响转录因子的结合而影响基因的表达水平,从而在疾病的发生中发挥作用;选择后两个SNP的依据是因为根据HapMap中HCB的数据,这两个SNP均为标签SNP,各自代表着一个不同的连锁不平衡板块(Linkage equilibriumblock)。利用PCR-RFLP方法在山东收集的年龄与性别匹配的551例哮喘病人和549例正常对照中进行了分型。经过统计学分析,三个位点在患者组与对照组均符合Hardy-Weinberg平衡,rs4704727位点和rs6882076位点的基因型、等位基因频率分布在哮喘组及对照组之间均有统计学差异,(P=0.005,OR=1.433 95%CI 1.11-1.84),(P=0.009,OR=1.35 95%CI 1.07-1.69)。rs12658558位点在患者与对照组的基因型和等位基因频率分布没有统计学差异(P=0.87)。连锁不平衡结果表明,rs4704727位点和rs6882076位点两者之间的r~2为0.12,处于非常弱的连锁不平衡状态,表明这两个位点很可能在哮喘的发生中具有独立的效应。以上结果表明,TIM-4基因在汉族人群的哮喘发生中具有一定的作用,是汉族人群哮喘的一个易感基因,但有待于在其他人群中进行进一步的验证。此外,还需要对这两个位点进行的功能分析来鉴定它们在哮喘发生中的作用。
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