企业是资本、劳动、技术和管理等不同要素所有者相互协调与合作的有机组织。合作剩余的创造和分配是企业的核心内容。剩余创造的最终目的是剩余分配。剩余分配是各个不同要素所有者相互协调与合作的基础，通过影响要素所有者事前的投资激励和事后的努力水平来影响企业合作效率，来影响企业剩余的创造。在制度环境不变的前提下，要素所有者拥有其要素所有权是参与剩余分配的前提条件。各不同生产要素在企业合作剩余创造的贡献是其参与合作剩余分配的基本依据，要素所有者在缔结和履行契约过程中的谈判势力是要素所有者参与剩余分配的决定性因素，包括各要素所有者投入企业的资产专用性程度、资产专有性和相对重要性的综合对比。　　 高新技术企业从事高新技术产品的研究、生产、开发、经营活动，具有高投入、高风险、高产出、高要求的主要特征。本文通过运用契约理论和博弈理论工具对高新技术企业中主要要素所有者包括风险资本家、企业家、核心技术人员两两之间的博弈关系进行静态分析，运用生命周期理论对各要素所有者的谈判势力在企业发展的不同阶段的变化进行动态分析，阐述高新技术企业的剩余分配是一个复杂的、动态的过程，是一个递进的、多层次的谈判过程。　　 高新技术企业剩余分配的主要方式，包括年薪、股票期权制度、员工持股计划、技术入股制度等等。通过对我国目前高新技术企业的剩余分配的现状分析，发现我国高新技术企业中还存在着如剩余分配方式混乱、剩余分配份额与要素贡献不相匹配、剩余分配缺乏成熟的制度环境支持等，导致提升合作效率的效果不明显，剩余创造路径不畅通等问题，同时指出我国高新技术企业剩余分配模式存在着向股票期权及衍生模式演进的趋势。　　 合理剩余分配，改善我国高新技术企业的合作效率，应高度重视和平衡高新技术企业剩余分配中核心利益相关者的利益，着力构建企业内要素所有者参与剩余分配的支持系统：考核系统、监督系统、反馈系统以及再谈判系统，加强高新技术企业相关法律法规、市场体制、政策支持体系等外部环境建设，结合实际，大胆创新，探索出适合中国国情和高新技术企业特点的剩余分配模式，从根本上促进高新技术合作效率的提升。