猪瘟(Classical Swine Fever，CSF)是由黄病毒科瘟病毒属的猪瘟病毒(Classical Swine Fever Virus，CSFV)引起的高度接触性、出血性猪传染病。虽然采取了法定免疫防制措施，该病仍在全国范围内不间断地流行，每年造成重大经济损失，而且流行态势日趋复杂。其中一个重要的技术原因是我国没有开展全国范围内的流行学研究，缺乏系统和全面的猪瘟流行病学本底资料用于指导防制工作。 为了弄清楚我国猪瘟病毒流行株的遗传变异情况和遗传多态性分布及其与免疫预防的关系，为我国控制和消灭猪瘟提供科学依据。(1)、本课题首次在全国范围内开展了大规模的CSFV病原生态学与分子流行病学研究，以大量详实的流行病学数据全面揭示了我国CSF的流行现状，即我国猪瘟大规模爆发基本停止，以全国范围内散发流行为主。常见非典型发病，3月龄以下仔猪发病和免疫力失败。母猪多见持续感染，但发病和死亡较少，仔猪时常发生先天感染；(2)、从全国各地收集到临床猪瘟病料(主要是脾脏、肾脏和淋巴结)392份，以分子流行病学研究方法从中扩增和分析了191株CSFV流行毒的E2基因序列，序列数据覆盖全国所有30个省、自治区和直辖市。通过与国外代表毒株基因序列所进行的多序列比较和系统发生分析，发现我国CSFV分为2个基因群，4个基因亚群，即基因2群中的2.1、2.2、2.3亚群和基因1群中的1.1亚群。基因2群在我国猪瘟流行中占主导地位，与欧洲流行的基因2群病毒有较近遗传关系，而与我国1945年分离的石门强毒有很近遗传关系的基因1群病毒在我国CSF流行中作用占次要地位。说明我国猪瘟除自身传播来源外可能还有国外的传播来源。在此基础上绘制了第一张中国猪瘟病毒遗传多样性地理分布图，初步建立了我国CSFV流行毒株和分子流行病学数据库；(3)、在国内首次成功地进行了DNA免疫制备病毒单克隆抗体的研究。以构建的CSFV DNA疫苗免疫Balb／C小鼠，制备了二株具有中和活性而且可以鉴别CSFV和BVDV的单克隆抗体；(4)、以兔化弱毒疫苗(HCLV)进行的本动物免疫试验证明了该疫苗对不同毒株可以产生同样的交叉免疫保护效果。 研究工作全面揭示了中国CSF的流行病学本底，CSFV的遗传变异及遗传多样性现状，阐明了我国CSF较为复杂流行态势，明确了猪群的随意流动是传播与扩散该病的重要原因。同时确立了分子流行病学研究在我国猪瘟流行病学调查中的重要地位。结果不仅对我国猪瘟防制具有重要的指导意义，而且填补了国际上CSFV分子流行病学研究缺乏中国数据这一空白，对建立该病毒的全球监测体系具有深远意义。本动物交叉免疫保护试验消除了疫病防制中普遍存在的有关病毒变异影响了疫苗免疫效果的顾虑，为我国坚持使用HCLV疫苗这一基本策略提供了确凿的科学证据。研制的单克隆抗体可用于开发CSFV特异性的标准化诊断试剂，为CSF诊断与监测提供可靠的检测技术。