野牡丹属(Melastoma)隶属于野牡丹科,许多种和变种具有优良的观赏特性和药用价值;其主要分布于亚洲南部至大洋洲北部,经历了快速的适应性辐射,在过去的一百万年中形成了约80-90个种,其中单是婆罗洲就发现41种。自然杂交在野牡丹属的物种形成和分化中发挥着重要作用,东南亚作为野牡丹属的分布中心,但目前尚不清楚自然杂交是否为东南亚的野牡丹属物种多样性形成的一个重要机制。本研究以马来西亚沙巴和沙捞越州的三个疑似杂交案例为研究材料,采用对三个核基因和一个叶绿体基因间隔区进行测序和序列分析等方法,首先确定一个未鉴定种的分类地位,评估两个具有多个地点群体的物种的遗传多样性和遗传分化,然后对这些杂交事件进行验证。案例I采自克拉克山脉(Crocker Range),包括一个未鉴定种(Rc),Melastoma beccarianum(Bc)和它们之间的疑似杂交种(BRc);案例II采自马西劳(Mesilau),包括一个未鉴定种(Rk),Melastoma boryanum(Bk)和它们之间的疑似杂交种(BRk);案例III采自美里市蓝卑尔国家公园(Lambir National Park),包括M.beccarianum(Bm),印度野牡丹(Melastoma malabatricum)(Mm)和它们之间的疑似杂交种(BMm)。得到的主要结果与结论如下:(1)确定了一个与印度野牡丹高度相似的未鉴定种是印度野牡丹的一个变种,并命名为“柔毛印度野牡丹”(Melastoma malabathricum var.tomentosum)。(2)印度野牡丹的各个群体都有较高的遗传多样性,柔毛印度野牡丹与印度野牡丹间有较低水平的遗传分化。M.beccarianum的两个群体都有较高的遗传多样性,遗传分化水平较高,尤其是vr基因,两个群体间没有共享的单倍型。(3)克拉克山脉的“柔毛印度野牡丹”(Rc)与M.beccarianum(Bc)发生了杂交和渐渗;马西劳的“柔毛印度野牡丹”(Rk)与M.boryanum(Bk)发生了杂交和渐渗;美里市蓝卑尔国家公园的印度野牡丹(Mm)与M.beccarianum(Bm)发生了杂交与渐渗,并以印度野牡丹(Mm)对M.beccarianum(Bm)单向的渐渗为主。本研究表明在东南亚的婆罗洲,自然杂交应该是野牡丹属物种多样性形成的一个重要机制。不同野牡丹属物种之间的渐渗可能会促进物种之间适应性性状的转移。但同时,近年来人类活动对野牡丹属生境的破坏会大大提高杂交发生的频率,广布种印度野牡丹与当地特有种M.beccarianum和M.boryanum的杂交可能会造成本土种繁殖能量的浪费,从而减少群体大小,引起本土种的保护生物学问题。因此本研究的成果对野牡丹属种质资源的保护也具有一定的理论和现实意义。