基于网络药理学及蛋白质组学探究益气化痰祛瘀方干预CIH大鼠心肌损伤研究

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目的:基于网络药理学和蛋白质组学探究益气化痰祛瘀方治疗慢性间歇低氧致心肌损伤的可能分子机制。方法:1.采用网络药理学的方法对益气化痰祛瘀方干预OSAHS相关心肌损害研究的作用及机制的分析步骤如下:通过TCMSP数据库查询益气化痰祛瘀方的成份并依据DL≥0.18、OB≥30%及满足Lipinski规则对益气化痰祛瘀方含有的化学成分进行筛选。并通过TCMSP及Pub Chem、STITCH、Swiss Target Prediction、BATMAN-TCM、Pharm Mapper数据库全面查询中药成分作用靶点,去除每味中重复数据,构建益气化痰祛瘀中药小分子化合物对应靶标数据库。在Pub Med、MEDLINE和Embase搜数据库中对已发表的有关“阻塞型睡眠呼吸暂停低通气综合征”的“基因,多态性和生物标记”的研究进行文献检索,使用阻塞性睡眠呼吸暂停(Me SH Unique ID:D020181)的英文检索术语:“Apnea,Obstructive Sleep”,并进一步检索Dis Ge NET数据库、NCBI Gene数据库搜索该病基因,建立OSAHS靶基因数据库。利用Metascape数据库进行GO功能富集、京都基因与基因组百科全书通路富集(KEGG)分析,获得功能、通路富集结果。得到益气化痰祛瘀方治疗OSAHS相关心肌损伤的主要作用通路,通过Cytoscape可视化软件对富集分析结果进行可视化处理。2.动物模型的建立:将动物分为3组:正常对照组6只、慢性间歇低氧组6只及慢性间歇低氧同时给予益气化痰祛瘀中药干预组6只。基于i TRAQ液相色谱-质谱联用分析技术进行心肌定量蛋白组学分析,生物信息学分析和注释Uni Prot蛋白数据库(http://www.uniprot.org/)用来对鉴定的蛋白进行功能注释。Blast2GO软件(v4.5 pipeline5)用来对各鉴定蛋白在分子功能、细胞所处位置、生物过程三个本体进行描述。KEGG数据库用来对鉴定蛋白间的相互作用及所参与的信号通路进行分析。GO富集分析用来寻找差异蛋白中显著富集的条目。结果:1.网络药理学分析结果:共得到满足OB≥30%和者DL≥0.18的益气化痰祛瘀中药潜在活性成分263种,阻塞性睡眠呼吸暂停低通气综合征人源基因285个。采用String数据库构建了益气化痰祛瘀中药的对抗阻塞性睡眠呼吸暂停低通气综合征体内反应网络。采用Metascape数据库对相互作用基因构建了GO生物学过程及KEGG通路富集分析,发现益气化痰祛瘀中药可通过靶向调控肥胖和糖脂代谢异常、心血管系统、炎症和中枢神经递质相关共有基因及通过IL-4和IL-13信号传导、细胞对脂质的反应、凋亡信号通路的负调节、对肿瘤坏死因子的反应、MAPK级联的正调节、调节炎症反应等通路对抗慢性间歇低氧诱导的炎症反应。2.通过i TRAQ定量蛋白组学鉴定慢性间歇低氧大鼠与益气化痰祛瘀中药干预后的差异表达蛋白共鉴定有统计学意义差异蛋白839个,筛选出了5个有意义的蛋白Anxa5、Serpina1、Myh6、Adipoq、Cryz;发现益气化痰祛瘀方干预大鼠心肌损伤后的差异蛋白主要参与内质网应激信号通路、肌动蛋白(actin)相关通路、PI3K/Akt信号通路等过程。从分子功能、细胞定位、生物学途径采用生物信息学分析差异蛋白相互作用网络。结论:1.通过构建益气化痰祛瘀化合物-靶点网络,我们筛选出了豆槲皮素Quercetin、木犀草素luteolin等主要有效成分,及热休克蛋白90(HSP90)、前列腺素内过氧化物合酶2(PTGS2)、过氧化物酶体增生激活受体y(PPAR‐γ)核心靶点,均可作用于炎症反应。通过构建益气化痰祛瘀作用靶点的PPI网络并对其进行模块化分解,我们筛选出69个与OSAHS候选基因靶点共有的基因,可以推测益气化痰祛瘀方可能通过靶向调控肥胖和糖脂代谢异常、心血管系统、炎症和中枢神经递质相关共有基因达到调控OSAHS靶器官损伤,对共有基因进行富集分析,可以推测益气化痰祛瘀方主要通过IL-4和IL-13信号传导、细胞对脂质的反应、凋亡信号通路的负调节、对肿瘤坏死因子的反应、MAPK级联的正调节、调节炎症反应等通路治疗OSAHS通路起到抗慢性间歇低氧诱导的相关并发症的作用。2.结合iTRAQ定量蛋白质组学筛选出了5个有意义的蛋白Anxa5、Serpina1、Myh6、Adipoq、Cryz,提示其可能作为益气化痰祛瘀方起干预慢性间歇低氧诱导心肌损伤作用的关键靶点;推测益气化痰祛瘀方干预大鼠心肌损伤主要通过内质网应激信号通路、肌动蛋白(actin)相关通路、PI3K/Akt等信号通路。单凭i TRAQ的定量所得到的结果也还需运用相关的分子生物学手段来进一步对相关蛋白、基因组水平的表达及功能进行验证和研究。
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