糖酵解酶GAPDH对钠通道基因的转录后调控及其在惊厥发生与生酮饮食抗惊厥中的作用机制

来源 :广州医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:dxy_10121012
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【目的】:  癫痫是大脑神经元高度同步化异常放电所导致的,以惊厥反复发作为临床特征的一种常见的神经系统疾病。现已证实电压依赖性钠离子通道(VGSC)功能及表达异常与癫痫发病密切相关,其中钠通道基因SCN1A表达水平下降及SCN3A表达水平上升被认为是促进癫痫发生发展的重要原因。生酮饮食(Ketogenic diet, KD)是一种高脂低碳水化合物的饮食疗法,主要用于治疗儿童难治性癫痫。过去多项研究提示, KD可能通过改变脑的能量代谢方式从基因表达调控、离子通道、抗氧化、神经保护、神经递质释放和突触传递等多条途径来调节细胞特性,降低神经网络兴奋性和缓冲样放电,从而起到抗癫痫作用。但其确切的分子机制仍有待于深入研究。  甘油醛-3-磷酸脱氢酶(Glyceraldehyde3-phosphate dehydrogenase,GAPDH)是糖酵解途径中的一个关键酶。现已证实,GAPDH还作为RNA结合蛋白参与其他基因的转录后调控。本研究发现,GAPDH与人和小鼠的SCN1A与SCN3A基因3′UTR区的一个保守区相结合,由此推测GAPDH所介导的钠通道基因表达调控很可能在癫痫及KD抗癫痫机制中发挥重要作用。  本研究拟通过体外及在体实验探索GAPDH参与调控钠通道基因表达的分子机制及其在惊厥发生及KD抗惊厥中的可能作用,为进一步了解癫痫的发病机制及优化临床诊治措施提供参考依据。  【方法】:  1、保守性分析:采用VectorNTI软件对人和小鼠SCN1A与SCN3A基因3′UT R区序列进行对比,获得保守序列。  2、RNA Electrophoretic Mobility Shift Assay(RNA-EMSA):以生物素标记的RNA保守序列作为探针,采用RNA-EMSA实验分析保守序列与细胞浆蛋白结合情况。  3、RNA Pull-down:采用Pull-down实验分离与保守序列结合的蛋白复合物,并采用液相色谱质谱联用技术(LC-MS/MS)分析复合物的蛋白成员。  4、Supershift实验:加入蛋白抗体,采用Supershift-EMSA实验进一步验证与CS1相结合的蛋白。  5、质粒构建:采用T-A克隆技术,构建钠通道基因3′UT R双荧光素酶报告基因表达载体;并以此为模板,采用定点诱变技术,构建缺失保守序列的载体(CS-Del型)。  6、双荧光报告系统检测:将重组的双荧光素酶表达载体转染至培养细胞,收获并裂解细胞,采用双赢素酶报告基因系统检测报告基因表达活性。  7、ShRNA敲降(ShRNA knockdown):从上海吉玛基因公司定制GAPDH特异敲降的ShRNA表达质粒,并转染至培养细胞,采用Western blot分析敲降效果。  8、mRNA稳定性分析:放线菌素D处理培养细胞,分别在0、3、5小时时间点,提取细胞总RNA,采用qRT-PCR检测报告基因mRNA水平。  9、惊厥动物模型构建及KD处理:采用注射海人酸方法构建惊厥小鼠模型,待观察到惊厥表现后,部分小鼠喂食KD饲料。  10、β-Hydroxybutyric acid(BHB)处理:使用5 mM的BHB处理细胞,分析处理后GAPDH及钠通道基因表达情况。  11、蛋白免疫沉淀(Immunoprecipitation,IP):采用免疫沉淀技术纯化组织及细胞中的GAPDH蛋白。  12、实时荧光定量PCR(qRT-PCR):用于检测组织及细胞的相关基因mRNA表达水平。  13、蛋白磷酸化检测:使用Phospho-PKC抗体,在Western blot实验检测组织及细胞的GAPDH蛋白Thr-244位点磷酸水平。  【结果】:  1、保守性分析发现,人及小鼠的SCN1A和SCN3A基因3′UTR存在3个共同保守区(分别命名CS1、CS2和CS3);RNA-EMSA证实,只有CS1能特异性结合细胞浆蛋白;进一步采用Pull-down联合SDS-PAGE实验发现,与CS1结合的蛋白复合物分子量大约为35-40kDa;LC-MS/MS测序及Surper-shift EMSA证实,GAPDH与CS1相结合。  2、报告基因检测结果显示,SCN1A基因3′UTR中CS1的缺失能显著性增强报告基因表达活性,而SCN3A基因3′UTR中CS1的缺失对报告基因表达活性没有影响;当敲降GAPDH表达时,可增强含SCN1A基因3′UTR的报告基因表达,而下调含SCN3A基因3′UTR的报告基因表达,对含有缺失CS1的SCN1A、SCN3A基因3′UTR的报告基因表达均无影响;进一步分析GAPDH对报告基因mRNA稳定性分析发现,GAPDH敲降导致含SCN1A基因3′UTR的报告基因mRNA稳定性增强,而含SCN3A基因3′UTR的报告基因mRNA稳定性减弱。上述结果提示:GAPDH可通过与CS1元件影响mRNA稳定性来下调SCN1A基因表达,上调SCN3A基因表达。  3、与正常小鼠相比较,惊厥小鼠海马组织中Scn1a的mRNA表达下调,而Scn3a的mRNA表达上调,GAPDH表达上调;与正常饮食的惊厥小鼠相比较,KD饮食的惊厥小鼠Scn1a表达上调,而Scn3a表达水平下调,同样GAPDH表达下调。这些结果提示在惊厥及KD条件下,GAPDH很可能参与Scn1a和Scn3a基因的表达改变。  4、通过纯化小鼠海马组织G APD H并进行磷酸化检测发现,与正常小鼠相比较,惊厥小鼠GAPDH蛋白Thr-244位点磷酸化水平显著性增加,且与CS1元件结合能力增强,而在KD饮食的惊厥小鼠中GAPDH磷酸化水平回复到正常小鼠水平,与CS1结合能力减弱;进一步体外实验证实,GAPDH去磷酸化后影响到蛋白与调控元件的结合。上述结果表明:在惊厥及KD条件下,GAPDH磷酸化修饰很可能参与Scn1a和Scn3a基因的表达改变。  5、为了进一步证实KD在调控钠通道基因中的作用,本研究体外分析了KD的一种代谢产物BHB对GAPDH及钠通道表达的影响。在BHB处理的  N1E-115细胞中,GAPDH表达下调,GAPDH蛋白Thr-244位点发生去磷酸化,并且BHB处理N1E-115细胞中表达的GAPDH对CS1结合能力下降;同样, BHB可导致Scn1a表达上调和Scn3a表达下调。双荧光素酶报告基因活性检测结果显示:BHB可增强含Scn1a基因3′UTR的报告基因表达,而下调含Scn3a基因3′UTR的报告基因表达。上述结果证实:BHB通过下调GAPDH及其去磷酸化来调控钠通道基因的表达。  【结论】:  本研究证实GAPDH可通过与钠通道基因3′UTR的保守序列相结合,调控其mRNA稳定性,在转录后水平上负性调控SCN1A表达而正性调控SCN3A表达。在惊厥条件下,GAPDH表达上调及发生Thr-244磷酸化致其与钠通道基因调控元件结合能力增强,从而下调Scn1a基因表达,并上调Scn3a基因表达;而KD处理后可回复这一系列过程。本研究首次揭示了GAPDH参与调控钠通道基因表达及其在惊厥发生及KD抗惊厥中的作用机制,为进一步理解癫痫发病机制及优化临床诊治措施提供参考依据。
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