艰难梭菌(Clostridium difficile,CD),是一种重要的人兽共患病原菌,该菌容易定植仔猪肠道导致仔猪肠炎。本研究旨在进行四川地区腹泻仔猪艰难梭菌的分子分型调查。首先,证实四川地区腹泻仔猪存在一定程度艰难梭菌感染。在四川地区6个养猪场共采集110份仔猪粪便标本,厌氧培养共分离艰难梭菌20株,其中用PCR扩增毒素基因tcdB鉴定了9株,用PCR扩增其16S rDNA鉴定了其余11株。四川地区腹泻仔猪艰难梭菌总分离率为18.2%(20/110),调查猪场阳性检出率为83.3%(5/6)。其次,发现四川地区腹泻仔猪艰难梭菌存在有3种毒素基因型。毒素基因分型里A+B+CDT-型包含菌株B3、B4、B5和B19(广安市邻水县),菌株LW3和LW6(南充市阆中市);A+B+CDT+型包含菌株C1和C2(成都市崇州市),菌株P1(眉山市彭山区);A-B-CDT-型包含菌株Y1-Y10(宜宾市江安县)、菌株P2(眉山市彭山区)。最后,鉴定四川地区腹泻仔猪有艰难梭菌5种多位点序列型。菌株B3、B4、B5和B19(广安市邻水县)菌株属ST36型;菌株C1、C2(成都市崇州市)和菌株P1(眉山市彭山区)菌株均为ST11型;菌株P2(眉山市彭山区)菌株属ST3型;菌株LW3和LW6(南充市阆中市)菌株属ST35型;菌株Y1-Y10(宜宾市江安县)菌株属ST109型。研究同时鉴定了3株ST11型艰难梭菌,揭示在四川地区腹泻仔猪群有高毒力菌株流行的风险。