基于核酸的高灵敏检测技术研究

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本文建立了两种基于核酸的高灵敏检测新方法,即靶标辅助核酸外切酶ExoⅢ催化信号放大荧光偏振方法及级联杂交信号放大的电化学传感检测方法。核酸外切酶ExoⅢ具有一种特性,它能够特异性识别双链DNA并沿3-5方向将其逐步切割为单核苷酸。利用这一特点,我们设计一种新型核酸外切酶ExoⅢ催化信号放大的荧光偏振方法。此技术基于传统的DNA杂交荧光偏振检测技术,由于体系中的核酸外切酶ExoⅢ只会选择性的消化双链DNA中的荧光标记探针链,不会消化靶标,因此靶标可以循环利用不断消化降解荧光标记探针链,显著提高检测灵敏度,最低检测限达到83aM。我们还对比了传统荧光偏振技术和此种新型荧光偏振技术的检测灵敏性与选择性。我们设计了具有一个错配碱基的DNA链和随机序列的DNA链,当靶标序列与荧光探针并未完全互补时,核酸外切酶ExoⅢ的消化效率下降,荧光偏振值加大,能够有效区分单碱基突变。实验证明此种检测技术具有很高的灵敏度和良好的选择性,是一种快速简单的DNA检测方法。建立了级联杂交信号放大电化学传感检测方法,并探讨了该方法在DNA及小分子ATP检测方面的应用。在此设计中,固定于金电极表面的探针与靶标DNA能与ATP形成三明治结构,靶标继续与两段部分序列互补配对的DNA链不断杂交形成长链,以吸附更多的电化学指示剂达到高的电化学信号响应值。实验能达到最低的ATP检测限为10fM,最低的DNA检测限为1aM。此检测平台选择性良好,可以从具有不同错配碱基数目的DNA链中有效区分出和探针完全互补的DNA链,可以从其他4种腺苷中有效区分出ATP。此E-DNA传感器在实际样本小牛血清中仍然运行良好。
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