组蛋白H2A.Z的伴侣蛋白Anp32e和Swc2/YL1的结构与功能研究

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在真核生物中除了基本的H2A,H2B,H3,H4之外,还存在一些重要的组蛋白变体发挥着重要的生物学功能,本论文研究的主要是H2A的变体H2AZ。H2A.Z在真核细胞中发挥着极其重要的生理功能,缺失H2A.Z在某些高等生物中是致死的。目前的研究已经发现H2A.Z在染色质稳定性,基因表达与抑制,DNA损伤修复中发挥着极其重要的作用。而H2A.Z在细胞质内表达,入核,最终被运输到染色质,以及在行使功能之后被H2A从染色质上替换下来,这些过程都需要组蛋白伴侣的协助。本论文的工作就是关于H2A.Z与其组蛋白伴侣Anp32e和YL1/Swc2的结构与功能的研究。  Anp32e是哺乳动物中能够特异性识别H2A.Z的伴侣蛋白,属于Anp32蛋白家族成员。本论文通过解析Anp32e与H2A.Z-H2B的晶体结构阐明了Anp32e特异性识别H2A.Z的分子基础,并通过ChIP-Seq实验揭示了Anp32e能够影响H2A.Z在基因组上的定位进而发挥其功能。  Swc2是染色质重塑复合物SWR1复合物发挥正常功能的一个必需亚基。SWR1复合物通过催化H2A.Z替换核小体中的H2A从而调控细胞生命活动,这也是H2A.Z能够在基因组上定位的主要方式。作为SWR1复合物功能的重要调控元件,Swc2不仅仅决定了SWR1复合物在基因组上的定位,还通过自身序列特异性决定了其对H2A.Z的特异性识别。本论文的工作基于Swc2在果蝇中的同源蛋白YL1与H2A.Z-H2B复合物的晶体结构提供的YL1/Swc2特异性识别H2A.Z的分子机制,进行了一系列的功能研究,最终证实了Swc2与H2A.Z-H2B的相互作用在调控H2A.Z在基因组上的定位中的重要性。共聚焦实验结果表明,YL1在细胞中能够与H2A.Z发生共定位。在酿酒酵母中,Swc2(作为YL1的同源蛋白)的缺失或者Swc2的HBD(histone binding domain)结构域的缺失能够极大地阻碍H2A.Z在基因组上的定位。SWR1复合物催化H2A.Z替换实验也显示HBD(histone binding domain)的缺失对SWR1复合物催化H2A.Z替换核小体中的H2A的能力有极大的影响。
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