媒介间议程设置理论作为议程设置理论的重要组成部分，问世以来备受学者关注。近些年，网络日益兴起，传统的媒介间议程设置模式受到冲击，逐渐改变。其中，报纸与网络媒体间议程设置改变尤为明显，在网络媒体崛起而报纸衰微的大背景下，二者之间的议程设置模式、议程设置角色、议程设置地位都发生了不小的变化。媒介是普通事件演变为舆情事件的主要平台，舆情的形成伴随着相关信息的披露、传播和扩散，这一过程实际上就是不同媒体互设议题、互相影响的过程。它们在互动过程中，通过原创或转载报道推动议题的流动和扩散，形成一个完整的报道体系。社会事件的舆情就是在媒体的互动中逐渐形成并一步步走向高潮。媒介间议程设置与舆情关系紧密，故面媒介间议程设置模式的变化也会对社会事件的舆情发展产生影响。21世纪，生物科学迅猛发展，转基因农作物问世并迅速普及开来，上世纪80年代我国开始了转基因技术的研究。但由于转基因食品的安全性至今没有肯定的说法，民众对其一直抱有难以接受的态度，从2004年的转基因水稻非法种植事件开始至今，转基因食品一而再成为舆论焦点，与之相关的事件再三演变为舆情事件。而这离不开媒介的推动，由于该话题的持久性和重大性以及与媒体关系的紧密性，本文以该话题为例来研究报纸与网络媒体的议程设置变化及其与舆情演变的关系。　　本文以报纸和网络媒体为主要研究对象，以媒介间议程设置理论为指导，采取内容分析法和个案研究法，以2004年至今，引发舆论热议并存在报网间议程设置现象的三个转基因食品事件为例，通过分析这三个事件中报纸和网络媒体相关议题的数量、议题流向、议程相关性及影响，将抽象的报纸与网络媒体间议程设置具象化，从而总结出在转基因食品事件中，报纸和网络媒体间的议程设置发生了什么变化，这些变化对舆论和舆情又产生了什么样的影响。面对舆情的变化，面对社会大背景和传播环境的变化，报纸和网络应该如何协调自己与大背景的关系，如何通过议程设置来加强对转基因食品舆论的正确引导。研究发现：⑴报纸在报网议程设置中的主导地位虽有所下降，但依然未让位于网络媒体。⑵报纸建构议题的作用有所减弱，网络媒体在溢散作用增强的情况下也开始起到了一定的建构议题的作用。⑶报网间议程设置中，议程设置模式更丰富。⑷随着时代发展，报纸与网络的互动性越来越强。这些变化也给舆情带来了正反两方面的影响:舆论更加多元化，舆情发展速度更快，但舆论乱象严重。现如今，社会处于转型期，矛盾凸显，另一方面，媒体系统内，新媒体不断出现，媒介技术不断发展，使得媒体引导舆论的难度加大，在这一复杂情形下，报纸和网络既要通力合作又要发挥各自优势，在互动中把握舆情监控、引导转基因食品舆论向正确健康方向发展。