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前人很多研究显示在丝绸之路中国区域的人群之间存在着广泛的基因融合，但是通过Y-SNP来揭示该区域群体父系遗传结构的相关报道依然是个空白。于是我们利用PCR-RFLP和测序等方法对丝绸之路中国区域六个少数民族，即撒拉、保安、裕固、克尔柯孜、塔塔尔和塔吉克的204个没有亲缘关系的男性个体的Y染色体非重组区域上18个双等位基因标记，即M1、M3、M9、M15、M45、M52、M62、M89、M95、M119、M120、M122、M124、M130、M134、M170、M172和M201(见附表)进行研究，仅发现了14种单倍型。为了更好地分析此结果，我们将它们与已报道的邻近的东亚和中亚人群的数据进行主成分、聚类、分子方差和混合度估计等方法分析，结果相当一致地显示了丝绸之路中国区域六个少数民族(中国西北群体)的等位基因频率总体上处在中亚群体(Tajik，Yagnobi，Tatar和Kurd)和东亚群体(北部汉族，藏族，满族和Korean)之间，并且明显不同于他们(中国西北民族基因频率更接近于中亚群体)。虽然我们的样本来至于同一地理区域，但仍然可以看出欧亚大陆西部的优势单倍群P-M45和F*-M89的频率从西向东呈递减的趋势，同时东亚优势的单倍群03-M122和K*-m9的频率则呈现出由西至东逐渐递增的态势。这很好地揭示了基因在丝绸之路上的流动，也很好地印证了丝绸之路地区多民族迁徙的历史，并且支持在该区域存在广泛地基因融合。结合历史记载，发现民族的起源、民族的迁徙史、近代与其他土著民族的融合、丝绸之路上的商业往来以及通婚习俗在构建丝绸之路区域的不同少数民族的父系遗传结构均起到了不同的作用。本研究不仅为丝绸之路中国区域少数民族遗传分析提供了新的数据，而且让我们更好地了解该区域民族的种族进化和该区域基因的流动和融合。