Kigamicin生物合成基因簇中orf60的研究

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Kigamicin是从放线菌中分离到的具有抗细菌和抗肿瘤活性的天然产物。其独特的生物学活性表现为能够抑制营养饥饿状态的肿瘤细胞,而对正常营养生长状态的细胞没有影响。因此,kigamicin可以作为开发特异性抗癌药物的重要来源。本论文通过对kigamicin的生物合成途径的研究,而研究过程中着重阐明kigamicin合成过程中新物质的化学结构。从而进一步了解kigamicin的化学结构与功能上的对应关系。为了研究orf60在kigamicin的生物合成中的功能,本论文开展了以下工作:首先,我们对orf0基因进行生物信息学分析,推测其编码的蛋白可能是一种单加氧酶。然后我们以PIJ778为模板采用PCR技术扩增出一段与orf60两端同源且带有壮观霉素抗性的置换片段。随后将这段置换片段以及整合型质粒pLL59一起转化到E.coil BW25113/pIJ 790中,通过PCR-Targeting技术我们得到重组质粒并命名为pLL200,通过抗性筛选以及PCR验证,证明orf0基因敲除成功。然后,我们将重组质粒pLL200以及质粒pLL68(含有激活因子)转入天蓝色链霉菌ML154,通过孢子接合转移方法得到了突变菌株ML20068。通过对比突变株M120068和野生株ML154发酵产物HPLC-MS的检测结果,发现突变株ML20068产生了[M+H]/Z=538 和 [M+H]/Z=513的两个新组分。它们与kigamicin具有相同UV吸收光谱。它们可能是Kigamicin生物合成过程中的中间产物或衍生物。我们通过对发酵产物分离纯化得到538组分12.6 mg和513组分9.0 mg。高分辨质谱拟合它们的元素组成,确定538组分的分子式为C 28H27NO10,513组分的分子式为(26H24O11最后通过核磁共振解析其化学结构,我们得到了538组分的化学结构。从而推测orf60在kigamicin的生物合成中的功能。
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