基团贡献法物性估算软件的开发

来源 :中国科学院大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:fondfood
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
物性数据是进行化工研究、生产、设计及开发的基石,化学数据库中收集整理了大量的实验测定的物性数据,这为物性数据的获取提供了极大的便利,但因实验测量难度较大、实验成本较高以及新物质的数量快速增长等问题,目前物性数据不足仍是普遍存在的情况,基团贡献法物性估算是解决这一问题的有效手段。基团贡献法是一类将分子结构片段(基团)对物性的影响(贡献值)加和来预测化合物的性质的方法,在化工计算中应用广泛。开发基团贡献法物性估算程序可以使用户简便、快速的利用基团贡献法进行物性估算,物性估算程序的核心是分子结构的自动拆解,然而在分子结构自动拆解中,不同的基团匹配顺序有可能造成拆解的结果出现多解或歧义,有时甚至会导致分子结构拆解失败,导致物性估算错误或无法进行。   针对这一问题,本文分析了基团贡献法定义基团间的相互关系,研究了不同结构重叠情况下,各类基团在分子结构拆解过程中的先后匹配顺序对拆解结果的影响,并以此为基础设计了分子结构拆解的基团优先级方法。以Joback、C-G和CSGC等典型基团贡献法为例对多种分子结构进行了拆解测试,结果表明基团优先级方法能够有效地解决分子结构自动拆解的多解问题。   在此研究的基础上,本文采用SMARTS编码建立了几种基团贡献法的基团优先级排序编码表,采用CACTVS化学工具库和Tcl语言开发了物性估算程序,并以此为基础实现了Joback、C-G和CSGC三物性估算方法。与文献报道的同类方法估算结果相比,本文开发物性估算程序可以获得相同精度的结果,这进一步表明了基团优先级方法的正确性及开发物性估算程序的可靠性。此外,程序还为新增基团贡献法的实现留下了接口。   考虑到物性估算程序与化学主题数据库的集成及其对外服务的需要,本文开发了物性估算Web服务,设计了基于XML的数据交换格式,在此基础上实现了化学主题数据库的物性估算功能,进一步提高了化学主题数据库服务的能力和水平。
其他文献
分子生态学与生态适应是当前生态学的研究热点。而针茅(Stipa)是欧亚草原的典型代表,以期丰富的种内与种间生物多样性适应不同的草原环境,是遗传多样性(genetic diversity)与环
  研究背景:唾液淀粉酶(salivary alpha-amylase,sAA)是唾液中含量最高且有重要功能的一类蛋白质.既往国内多家单位在多种疾病的研究发现,脾气虚证患者酸刺激后sAA活性比值(
会议
  新奥法隧硐施工法的精髓就是允许围岩适度变形,对围岩初始应力部分释放,在产生大的变形前及时用柔性支护防护进行约束,形成承载环,充分利用围岩的自承能力,大大减少支护工作量
会议
化工反应器的设计和放大是化学反应工程研究的核心内容。搅拌槽是过程工业中最常见的反应器之一,它具有相际接触面积大、传热和传质效率高、操作弹性大等特点,在化工、石化、
总的来说,我国对于足球这项运动的重视程度还是很高的,但由于种种原因,我国的足球运动的发展并不是很好,在各种国际性比赛中也处于落后性地位,造成这种情况的原因就是我国足
  某拟建水电站工程地区发育有Chipwi韧性剪切带,宽约500~800 m,系区域上顺主干河流不具活动性的May Kha断裂构造形迹组成的骨架,穿越混凝土重力坝左岸坝基。采用构造地质学
会议
学位
在2009年之前,王臻的生活还算顺利。但一场突如其来的疾病,让他失去了光明。离开职场,王臻转型成了一名残疾人创客。日前,在洛川东路201号一楼残疾人“创客201”内,王臻面对5
质子交换膜燃料电池(protonexchangemembranefuelcell,PEMFC)通常以环境空气作阴极氧化剂,而空气中往往含有一定量CO、NOx及SO2等杂质气体。这些杂质气体即使浓度很低也会毒化
本研究测定了金针菇(Flammulina velutipes (Fr.) Singer)作图群体120个单孢菌株的交配极性,在此基础上建立了107个双核菌株的F2群体。利用三明虎头山野生单孢菌株与金21单孢菌株