羊草(Leymus chinensis)种群之间在许多性状方面产生了趋异,其中以不同叶色表型的特征最为明显,而叶片是植物进化过程中对环境变化较敏感且可塑性较大的器官,其结构特征最能体现植物对环境的适应。在天然草原羊草种群中,不同叶色性状表现稳定,同一生境的同一叶色羊草在整个生长季颜色一致,肉眼可以清晰分辨,羊草的不同叶色从典型的灰绿色到典型的黄绿色之间存在次灰绿色、次黄绿色以及中间过渡叶色等几种叶色,已形成明显的叶色渐变群。本研究对长岭、图牧吉和沽源三个天然草原不同土壤类型5种叶色羊草种子为实验材料,研究其子代羊草遗传多样性,从DNA水平分析羊草叶色渐变群子代的遗传结构和遗传多样性。结果表明:19个引物共检测出扩增位点347个,其中多态位点比率高达100%。从不同地区来分析,羊草种群多态性比率为90.01%,从不同叶色羊草种群来分析,羊草种群多态性比率为68.21%,这些都表明羊草子代具有很高的遗传多样性。无论从观察等位基因Na、有效等位基因Ne、多态位点、多态位点比率P、Nei’s遗传多样性指数H、Shannon信息指数Ⅰ来分析羊草种群遗传多样性都是按照长岭、图牧吉、沽源地区递减的。在三个地区五种叶色羊草种群中,长岭地区灰绿色或次灰绿色羊草遗传多样性水平高,黄绿色羊草遗传多样性水平低。图牧吉中间色或次黄绿色羊草种群遗传多样性水平高,灰绿色羊草种群遗传多样性水平低。沽源地区中间色羊草种群遗传多样性水平高,次黄绿色羊草种群遗传多样性水平低。在三个地区不同土壤类型羊草种群的Na、Ne、多态位点数、P、H、I都是按照长岭草甸>沽源栗钙>图牧吉栗钙>长岭盐碱>长岭风沙>沽源盐碱>图牧吉盐碱递减。应用AMOVA分别对三个地区、三个地区不同叶色和三个地区不同土壤类型羊草种群进行遗传变异分析。对三个地区进行分析种群间和种群内的遗传变异分别为13%和87%。对三个地区五种叶色羊草进行分析,长岭地区14%和86%,图牧吉地区为9%和91%,沽源地区为17%和83%的遗传变异存在与种群间和种群内。对不同地区不同土壤类型羊草进行分析,长岭地区30%和70%,图牧吉地区37%和63%,沽源地区42%和58%的遗传变异存在与种群间和种群内。综上所述羊草种群内的遗传变异大于种群间的,表明羊草叶色渐变群遗传变异主要来自于种群内部。长岭与图牧吉地区羊草叶色渐变群的遗传一致度最大、遗传距离最小,亲缘关系最近。长岭与沽源地区羊草叶色渐变群的遗传一致度最小、遗传距离最大,亲缘关系最远。长岭地区次灰绿色与中间色羊草种群的遗传一致度最大、遗传距离最小,亲缘关系最近。图牧吉地区次黄绿色与黄绿色羊草种群的遗传一致度最大、遗传距离最小,亲缘关系最近。沽源地区灰绿色与中间色羊草种群的遗传一致度最大、遗传距离最小,亲缘关系最近。除长岭草甸灰绿色羊草外,每个土壤类型五种叶色首先聚为一类,形成一个进化单元。除长岭盐碱土外,其他土壤类型都是灰绿色或黄绿色羊草总是最先分化出来。Network软件对羊草种群进行分析,长岭地区盐碱土羊草种群最先分化、然后是风沙土、最后是草甸土。图牧吉和沽源地区都是栗钙土先分化,盐碱土后分化。叶色分化主要由于遗传漂变引起,在不同生境形成不同叶色表型的分化历程;但分化的结果是相同的,形成不同表型的分化,即在不同的土壤类型、气候条件及生存压力下,种群具有相同的平行进化的过程。