所有权和控制权的分离引发了最初关于公司治理问题的研究，近些年来一系列跨国公司丑闻以及倒闭事件的发生更是引发了人们对于公司治理的新的重视。各国纷纷推出了一系列的准则以及相应的法规，来推动公司治理的改善。至于是采取强制的方式使公司统一遵守，还是公司根据自身的情况自主决定，各国监管当局的作法不一。究竟哪种方式更有效成了关注的焦点。本文着眼于公司是否会按准则的规定执行，不按规则改进治理是否会对公司价值产生负面的影响：公司自愿地进行的治理创新活动的效果如何。　　 本文主要结合国内外关于公司治理合规性、自主性治理的研究成果，分析了合规性治理的有效性以及其适用的一些条件：同时本文也从成本和收益的角度分析了公司是否会进行自主的公司治理的创新活动，这为本文的研究提供了理论依据。具体的研究思路上，本文在国内外文献综述的基础上，阐述了公司治理从对单个公司治理机制，如股东行为、董事会、经理层的激励机制以及外部环境等的研究，到后来在此基础上的通过构建公司治理综合评价指数的一系列研究以及在此基础上进行的公司合规性治理、自主性治理治理的研究分析。在研究方法上，我们主要借鉴以往文献的研究成果，通过构建指数的形式来衡量上市公司合规治理和自主治理的程度。这样既能和其他公司进行横向比较，又能对公司自身治理机制存在的某一方面的问题进行有针对性的改治，为最大程度上实现上市公司各治理机制的完美协调提供借鉴。　　 在理论研究的基础上，实证方面本文主要采用我国上市公司的治理数据，构建了关于我国上市公司合规问题指数和自主创新指数。结果发现，我国上市公司的自主治理水平总体较低，且对公司价值的影响并不显著，这可能主要是由于自主治理的较大成本造成的。合规问题指数主要对上市公司的价值产生负的影响，说明违规治理确实会造成公司效率的低下。在这其中，股东权利分指数和董事会与监事会分指数起主要作用。通过分组分析，问题指数的负作用主要是由于股权分散的那一部分公司引起的；国有上市公司的问题指数的负作用尤为明显。创新型公司比其它几类公司对公司价值产生的影响比其它几类公司都要好。