高等培菌白蚁高效利用木质纤维素的机理研究

来源 :安徽农业大学 | 被引量 : 13次 | 上传用户:zjkghost10
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培菌白蚁属于高等白蚁白蚁科(Termitidae)、大白蚁亚科(Macrotermitinae),因与Termitomyces属真菌共生而得名。由于在热带干旱地区可消耗90%以上的干木、在多雨的热带草原地区能矿化20%的初级产物而引起研究学者们的广泛研究兴趣。在初步了解高等白蚁与其培养真菌的共生关系后,本研究利用分子生物学技术调查了共生系统中白蚁肠道及菌圃共生生物的多样性,通过cDNA文库的构建从共生真菌中筛选与木质纤维素降解相关的基因。主要研究内容如下:在安徽省、湖南省、江苏省、云南省等地广泛采集白蚁标本,建立了白蚁的形态鉴定和分子鉴定平台,利用ISSR分子标记调查了在上述地区广泛分布的高等、低等白蚁种群的遗传多样性及其与系统发育的关系。得到如下结果:①候选的24个ISSR引物中筛选出10个能得到清晰条带、重复性好、多态性高的引物,在14个白蚁群体中共扩增出145条带,平均每个引物扩增出14.5条带,多态性条带有144条,占总条带的99.31%,可见平均等位基因数(na)为1.9931±0.0830,平均有效等位基因数(ne)为1.5661±0.3043,Nei’s基因多样性指数(h)和Shannon’s信息指数(Ⅰ)在分别为0.3355±0.1363和0.5065±0.1645,表明所有供试种群具有较高的遗传多样性;而三个不同种类种群多样性受地理条件影响较大,地理上的分隔很可能阻碍了种群内的基因交流;②一个种群内不同品级问的ISSR-PCR扩增格局是相同的,并且在一个品级内不同个体间的扩增也是稳定的,从而确定在缺失兵蚁的情况下也可以利用工蚁进行分子鉴定和种群多样性的调查;③利用PAUP软件分别对所有种群的COⅡ序列及ISSR-PCR电泳条带生成的0/1矩阵构建系统发育树,结果表明,两个系统发育树的拓扑结构相似,且都较好地与形态分类结果相吻合,显示了物种遗传多样性与其进化是保持一致的,同时也显示了ISSR分子标记是一个进行系统发育分析的有力工具。对广泛采集得到的白蚁种群进行高通量酶活测定,通过比较不同地区采集的17个种群、5种高等白蚁的4种纤维素酶酶活后,选择在西双版纳地区广泛分布的云南土白蚁(Odontotermes yunnanensis)及其共生Termitomyces属真菌作为研究对象。为探讨共生系统原核生物所发挥的作用,分别构建白蚁肠道细菌16s rDNA全长序列克隆文库和菌圃细菌16s rDNA全长序列克隆文库进行微生物区系的调查。其中,白蚁肠道细菌16s rDNA文库分析显示,623条可用序列被分成187个系统发育型,其中丰度最高的是厚壁菌门(Firmicutes)(占38%),94.4%的系统发育型比对上梭菌纲(Clostridia)、梭菌目(Clostridiales)的纯培养或未培微生物;其次分别是拟杆菌门(Bacteroidetes)(占26.7%)、变形菌门(Proteobacteria)(占11.8%)、螺旋体门(Spirochaetes)(占8%),拟杆菌目(Bacteroidales)、δ-变形菌纲(Deltaproteobacteria)、密螺旋体属(Treponema)分别是它们相应的优势群体;而浮霉菌门(Planctomycetes)、放线菌门(Actinobacteria)、TM7门、脱铁杆菌门(Deferribacteres)、绿菌门(Chlorobi)及TG1门的丰度则较低。而菌圃细菌文库分析表明,菌圃上细菌菌群的多样性明显低于肠道菌群,但厚壁菌门、变形菌门及拟杆菌门仍为主要组成。在成功分离得到菌圃上的共生真菌Termitomyces sp.菌株后,对其展开了一系列基础研究。得到以下结论:①生长于菌圃上的野生菌大部分情况下成小白球状,经显微镜观察可见由无数产孢结构和长椭圆形分生孢子构成,并判断分生孢子是由庞大的球状胞原生质体浓缩而分隔开形成的;②纯化菌株的ITS区序列(GenBANK号:FJ769410)与野生菌株的ITS区序列(GenBANK号FJ769409)基本一致,表明两者为同一菌株,同时在分类地位上都与Termitomyces sp.Group 8(AB073529)较近,但由于缺乏野外形成的子实体形状等分类信息,只能将该菌株鉴定为Termitomyces sp.;③菌圃及白蚁肠道真菌多样性的分析表明,在野外良好的共生状态下,菌圃上只生长一种Termitomyces属真菌,未见其他真菌生存,且白蚁肠道真菌与其为同一种,表明该共生真菌为白蚁食物组成的一部分。考虑到在共生状态下,共生真菌极可能在木质纤维素降解过程中发挥着重要作用,本研究首次利用直接在野外菌圃上采集的野生菌为材料,通过SMARTTM cDNA文库构建试剂盒构建了一个全长cDNA文库。所构建的文库经检测,文库滴度为7×106Pfu/μl,库容量为3.5×106Pfu,文库重组率达97%,平均插入片段长度约为1.33 Kb,文库质量合格。在此基础上,建立了引物PCR筛选目的基因的技术平台,经过两轮PCR筛选成功获得一个含木聚糖酶基因的阳性克隆,记为XylC5。该目的基因序列在3’端存在明显的polyA结构,可编码226个氨基酸,预测分子量大小约为24 KDa,在43位氨基酸至223位氨基酸处为GHF11的功能域,并且129氨基酸和220氨基酸两个位点为活性位点,均为谷氨酸,NCBI比对后多数与曲霉属Aspergillus真菌木聚糖酶基因的序列一致性在58%-60%,可判定这是首个来自Termitomyces属真菌的木聚糖酶基因。最后,构建了一个pET22bXylC5重组质粒、转化感受态大肠杆菌BL21进行诱导表达,经SDS-PAGE分析表明,目的蛋白表达出两条大小分别约为17 KDa、15 KDa的条带,且为不可溶性蛋白。该结果与预测的蛋白大小存在差距,可能是由于原核表达体系不适合表达真核来源基因或表达过程的各种折叠、修饰等步骤的原因导致的。
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