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肺癌是导致肿瘤死亡的首要原因。在过去的几十年中，我们对肺癌变的生物学特性有所了解，然而，对其内在机制还不清楚。 为了筛选肺癌相关差别表达基因，我们通过抑制性消减杂交方法，分别利用6例低分化肺鳞癌肿瘤组织和10例癌旁支气管上皮组织、原代培养的肺鳞癌肿瘤细胞和原代培养的癌旁支气管上皮细胞构建了“肺癌新鲜肿瘤组织高／低表达基因文库”和“原代培养的肺癌细胞高／低表达基因文库”，共获得414个肺癌相关高表达基因和571个肺癌相关低表达基因；与此同时，我们也利用包含2800个基因的cDNA微阵列，比较14例肺鳞癌组织与混合的经原代培养的癌旁支气管上皮细胞(来源于多例肺癌患者)的基因表达谱，从中获得67肺癌相关高表达基因和98个肺癌相关低表达基因。 我们从上述筛选的差别表达基因中选择46个肺癌相关高表达基因，选取25例肺鳞癌组织和其相应的癌旁组织，应用RTPCR方法检测它们在肺癌的表达状况。结果显示，35个基因(76.1％)在肺鳞癌组织呈现高表达，与抑制性消减杂交方法或cDNA微阵列分析的实验结果一致(本实验室多人合作完成)；作者所承担的RTPCR实验结果中，RNF34、CLDN1、ADAM10、BAZ1A、C200RF139、C200RF1、SQLE、IQGAP1、MARK1、MLF1、PAICS、RAP1GDS1、NICE4、TSN、CXCR4、GBP1为肺癌组织高表达基因。在此基础上，我们选取IQGAP1和BAZ1A，应用组织微阵列进行免疫组织化学检测，发现，IQGAP1在64.7％(205／317)的肺鳞癌组织呈阳性表达，而100％(41／41)的肺癌旁组织均未出现IQGAP1阳性表达：BAZ1A在46.8％(147／314)的肺鳞癌组织呈BAZ1A蛋白阳性表达，而100％(43／43)的肺癌旁组织均未出现BAZ1A蛋白阳性表达；IQGAP1蛋白和BAZ1A蛋白在肺鳞癌组织高表达(P＜0.01)，与RTPCR结果一致。这些结果提示，我们筛选获得的肺癌相关差别表达基因对未来研究具有潜在价值。 为了全面分析和探讨应用抑制性消减杂交方法和cDNA微阵列技术筛选获得的肺癌相关差别表达基因，我们根据本项研究的肺癌相关差别表达基因结果，并结合本实验室前期工作中，通过构建“永生化支气管上皮细胞高／低表达文库”获得的156个永生化支气管上皮细胞上调表达基因和126个永生化支气管下调表达基因(安倩，2002；An Q et al．，2003)，进行生物信息学初步分析。从中，我们发现了在三对肺癌相关基因文库或者