陕西茶树种质资源DNA指纹图谱构建

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茶树是我国重要的经济作物,陕南茶区作为我国最北端的茶区,茶树栽培历史非常悠久,同时也因漫长的栽培历史积累了很丰富的茶树种质资源。本研究通过对陕西各茶区的不同品类茶树资源的遗传多样性进行分析,利用3种分子标记的分别构建了陕西省茶树种质资源DNA指纹图谱。主要结果如下:1.选用6份有代表性的陕西茶树资源材料,根据扩增条带清晰程度、多态性高低,从154对SRAP引物组合中筛选出40对引物,构建出陕西地区的茶树资源的SRAP标记指纹图谱。对本省50份茶树资源的遗传多样性研究之后,结果显示40对SRAP引物共检测到338个等位基因,每对引物组合可检测到的等位位点为5~13个,平均为8.45;每个SRAP位点的遗传多态性信息含量为0.78~0.99,计算得到平均值为0.93。实验材料两两间的遗传相似系数集中分布在0.49~0.69之间。2.筛选出40对EST-SSR引物组合,构建出陕西地区的茶树资源的EST-SSR标记指纹图谱。40对引物检测到320个等位基因,每对引物组合可检测到3~16个等位位点,平均8个;每个位点的遗传多态性信息含量在0.76~0.99之间,得平均值为0.94。实验材料两两间的遗传相似系数集中于0.55~0.77之间。3.筛选出的38条SCoT引物,构建出陕西地区的茶树资源的SCoT标记指纹图谱。每条引物可检测到4~17个等位位点,平均为10.89个,38条SCoT引物共扩增得到414条DNA片段,每个SCoT位点的遗传多态性信息含量在0.56~0.98之间,平均为0.89。计算得出两两遗传相似系数集中于0.48~0.74之间。4.通过对比这3种分子标记扩增出的多态性条带的比例(PPB)、引物多态性的信息含量(PIC)和位点平均信息量(Ibav)等指标及对有效多元比率(EMR)、引物解析强度(Rp)、标记指数(MI)等方面的差异性分析,得到40对SRAP引物的PPB、PIC、EMR、Ibav、Rp、MI值分别为89.34%、0.93、7.55、0.61、5.11、4.61;40对EST-SSR引物的PPB、PIC、EMR、Ibav、Rp、MI值分别为94.06%、0.94、7.53、0.56、4.48、4.22;38个SCoT引物的PPB、PIC、EMR、Ibav、Rp、MI值分别为96.14%、0.89、10.47、0.58、6.71、6.07。这3种标记体系所检测到的EMR、Rp和MI值得出:最高为SCoT、其次为SRAP、最低为EST-SSR,但PIC值是EST-SSR的最高,其次为SRAP,最后为SCoT。结果表明SCoT具有相对较高的标记效率,而EST-SSR标记,则具有更丰富的位点多态信息。3种分子标记分别构建出50份陕西茶树种质资源的DNA指纹图谱,反映出了陕西茶树品种在分子水平上具有较高的遗传多样性,为系统选育和杂交育种工作提供了一定理论基础。
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