猪流感病毒的分离鉴定及NA基因的序列分析

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猪流感(SI)是由猪流感病毒(Swine influenza virus,SIV)引起的不同日龄、性别和品种猪的一种群发性呼吸道传染病。迄今为止,SI已遍布美、欧、亚、非等世界各地。猪流感的暴发,对全球养殖业造成了巨大的经济损失。因此,了解SI在我国的流行情况并对其研究,不仅可促进我国畜牧业的健康稳定发展,也是防止人类流感流行的重要环节。本研究从广西各地收集有呼吸症状的鼻粘液、气管粘液和病变肺组织,将经RT-PCR初步检测为阳性的样品,用11日龄鸡胚接种后分离到3株SIV,经HI、RT-PCR鉴定,其中GXHZ株为H1N2亚型毒株,GXLZ、GXXY株为H3N2亚型毒株。然后对分离株进行EID50及GXHZ株的攻毒猪试验研究。结果表明:病毒稀释后接种11日龄鸡胚,不能导致鸡胚的死亡,3株SIV广西分离株GXHZ、GXLZ和GXXY的EID50分别为10-5.3EID50/0.2ml,10-4.7EID50/0.2ml与10-5.5EID50/0.2ml。GXHZ株攻毒猪后没有明显的临床症状,只在第四、五天从采集的猪鼻粘液中重新分离到病毒。用一对特异性引物NA1、NA2经RT-PCR法扩增了分离到的3株SIV的NA基因的cDNA片段,测定核苷酸序列,并推导出相应的氨基酸序列与国内外相应序列进行比较。结果表明,所扩增的3株SIV病毒NA基因长度均为1410个核苷酸,共编码469个氨基酸,3个分离株之间的核苷酸和氨基酸同源性很高,分别达到99.8%以上和99.4以上。3株分离株的NA基因序列与已发表H1N2、H3N2亚型参考毒株的同源性较高,核苷酸同源性分别达到了82.9~98.1%、97.0~99.7,氨基酸同源性分别达到了83.2~98.5%、96.8~99.4。与参考的近年发表毒株EF556202(A/swine/Guangxi/17/05(H1N2)),EF566204(A/swine/Hainan/1/05(H1N2)),EF556200(A/swine/Guangxi/13/06(H1N2)),AF251412(A/Swine/Iowa/533/99(H3N2))比较结果发现,核苷酸的同源性为97.4~99.7%,氨基酸同源性为97.9~99.4%。与古典型参考的代表毒株D00715(A/sw/Hong Kong/3/76(H3N2)),D00716(A/sw/Hong Kong/4/76(H3N2)),AB101674(A/Hong Kong/1/68(H3N2)),CY009302(A/Swine/Colorado/1/77(H3N2))的核苷酸同源性为87.7~91.3%,氨基酸同源性为87.4~91.7%。系统发育分析表明本实验所分离的3个SIV毒株均属于N2亚型,与H1N2亚型毒株亲缘性最相近,特别与中国海南毒株EF566204(A/swine/Hainan/1/05(H1N2)),以及中国广西毒株EF556202(A/swine/Guangxi/17/05(H1N2))与EF556200(A/swine/Guangxi/13/06(H1N2))毒株同源性最高。从时间上也发现,三个分离株的NA基因与1996年以后获得的H3N2毒株亲缘关系很近,都隶属于一个亚分支,但与古典分离株都有较大差异。
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