长链非编码RNA Tug1与新生大鼠肺发育的关系及其潜在作用机制的研究

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目的:支气管肺发育不良(bronchopulmonary dysplasia,BPD)是一种早产儿中非常常见的并发症。伴随着围产医学的迅速发展,呼吸支持策略的不断优化,肺表面活性物质的及时应用,极低和超低出生体重儿的存活率逐渐升高,而BPD的发病率也逐年上升。其遗留的短期或长期不良结局不仅会给患儿的生命和生活质量带来影响,还会给患儿的家庭乃至整个社会带来沉重的经济负担。新型BPD的发生与肺发育不成熟有着密切的关系,胎龄小,出生体重低的早产儿更易患BPD。胚胎肺发育分为五个时期,其中肺泡期为肺泡发育成熟的关键时期,大多数早产儿出生时肺发育处于囊泡期,肺部解剖结构及生理功能尚不成熟,极易受高氧、机械通气压力等因素的影响,使肺泡发育进程受阻,表现为肺发育停滞、肺泡简单化和肺小血管发育不良。近年,有研究证实lncRNA可以与转录因子相互作用参与肺发育的调控及BPD的发生发展。LncRNA Tug1是一个与发育相关的指标,已被证实在大脑皮层、神经元及视网膜发育中扮演重要角色。但是Tug1与肺发育的关系尚未有相关报道。本研究通过生物信息学分析、PCR、WB、相关性分析与Chirp-MS等方法,旨在阐明Tug1与肺发育及BPD的关系,为“新型”BPD肺发育障碍机制研究奠定基础。研究方法:在GEO数据库中选取肝脏、耳蜗、大脑、小肠及血液中内皮细胞成年期及胚胎末期或新生期mRNA表达芯片,利用GEO2R以成年期为对照组,胚胎末期或新生期为实验组,以P<0.05、|logFC|≥1为标准计算差异表达基因。五个数据集取交集后对结果进行聚类分析。在GEO数据库中选取肺组织及肺泡Ⅱ型上皮细胞成年期与胚胎18天mRNA表达芯片,同前进行差异表达分析,并与前5个数据集交集的结果取交集。高氧诱导新生SD大鼠制备BPD模型(氧浓度为85%,n=40),对照组为空气环境正常生长的新生SD大鼠(氧浓度21%,n=40)。每组分别于生后1天、3天、7天、14天随机取10只采集肺组织样本。通过苏木精-伊红染色观察肺组织形态学改变,应用辐射状肺泡计数法(RAC)评估肺泡发育成熟度。采用实时荧光定量PCR(RT-PCR)技术检测肺组织中长链非编码RNA Tug1与Pdgfra的mRNA表达水平。采用Western Blot方法检测Pdgfra的蛋白表达。荧光原位杂交技术观察Tug1的细胞定位。GEO数据库中选取肺泡发育过程mRNA表达高通量测序集,利用cot.test函数计算Tug1共表达基因。肺泡发育时期Tug1的共表达基因,并对结果进行功能富集分析,利用Chirp-MS技术检测与Tug1直接结合的蛋白。结果:Tug1在肝脏、耳蜗、大脑、小肠及血液中内皮细胞五种组织细胞的的胚胎末期及新生期表达均显著高于成年期。在胚胎18天的肺组织及肺泡二型上皮细胞中表达均高于成年期。在肺组织中,Pdgfra的mRNA表达从7天开始显著低于对照组(对照组1.62±0.37模型组1.04±0.25 P=0.002)趋势持续至14天。Pdgfra蛋白表达在对照组随日龄增加呈递增趋势,模型组7天开始显著低于对照组(对照组1.62±0.09,模型组1.04±0.13 P=0.04)趋势持续至14天。对照组Tug1表达随日龄呈递增趋势,且Tug1的表达与RAC值呈显著正相关(P=0.007,r=0.648),同时与Pdgfra的蛋白表达呈显著正相关(P=0.001,r=0.755)。模型组中,Tug1表达从7天开始显著低于对照组(对照组1.68±0.20,模型组0.78±0.20 P=0.04),趋势持续至14天。在肺泡发育期与Tug1共表达基因在FDR<0.05水平共338个大多参与细胞能量代谢及产物分解过程,并与后胚胎发育关系密切。其中Uba52与Rps27a在Chirp-MS实验中被证实与Tug1直接结合。结论:长链非编码RNA Tug1与肺泡发育密切相关,BPD新生大鼠肺组织中Tug1表达降低。Tug1可能通过直接调控Uba52或间接调控Smarca1和Cdkn1c参与正常肺泡发育及阻滞BPD肺泡发育。
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