凉山半细毛羊1号染色体遗传连锁图和羊毛性状QTL定位研究

来源 :四川农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:qinlinjie8
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本研究用凉山半细毛羊的8个父系半同胞家系的245个后裔组建成的资源参考群进行了1号染色体遗传连锁图的构建和部分羊毛性状QTL初步定位。实验共计检测了387个个体的9个微卫星标记的基因型数据。各个标记的群体平均等位基因数为8.44个;平均杂合度H=0.617;平均多态信息含量PIC=0.604,其中有7个标记表现高度多态性(PIC≥0.5)。说明试验所用的标记具有丰富的多态性,可以用于连锁图谱的构建和QTL定位分析。用于QTL分析的性状为断奶羊毛纤维长度(BMC)、断奶羊毛纤维细度(BXD)、育成羊毛纤维长度(CMC)、育成羊毛纤维细度(CXD)、育成腹部羊毛纤维长度(CFM)、育成剪毛量(CJML)、成年羊毛纤维长度(DMC)、成年羊毛纤维直径(DXD)、成年腹部羊毛纤维长度(DFM)、成年剪毛量(DJML)等。 所构建的凉山半细毛羊1号染色体的遗传连锁图,总长311.0cM,9个微卫星标记平均间距为38.9cM。连锁图中最小的间距为BM6465与BMS1636之间(17.8cM);最大间距为标记MCM58和标记BMS2321之间(58.8cM)。 对试验群体的245个后裔及其亲本的毛性状进行了测量和表型分析。各性状间相关分析结果表明,BMC与CMC、CMC与DMC之间极显著相关,CMC与CJML、DMC与DJML之间显著相关。各性状在不同家系和年龄主效应下的方差分析结果:家系效应对BMC和CMC影响极显著(P<0.01),对DMC、DFM、DJML有显著影响(P<0.05),对CFM、CJML和DXD影响不显著;年龄因素对BMC的影响显著(P<0.05),对CJML、DJML、DMC和DXD影响极显著(P<0.01),而对其余的性状无显著影响。 用两种不同的软件对羊毛性状进行QTL分析的结果表明,共同检测达到显著水平的是CMC和CXD的QTL,但具体位置有所差异。用QTL Express检测的结果,影响CMC的一个QTL位于标记BMS2321和标记BM6506之间的215cM处,而用Win QTL分析结果,该QTL则位于BM6506标记的231.6cM处,虽然存在一定差异,但还是在估计的95%的QTL置信区间范围内(201.5 cM~261.9cM),与标记BM6506相连锁,具有一定的可靠性。影响CXD的QTL在两个作图软件分析结果中差异较大,其中QTL Express的分析结果是位于标记BMS835和BMS2145间的13cM处,而在Win QTL分析的结果中位于标记BMS2321和标记BM6506间的203.1cM位置上,造成该结果的原因有待进一步研究。此外,在其中的一个软件的分析结果中达到0.05显著水平的QTL还有:BMC在191家系有1个QTL(260cM);CJML有3个QTL:189家系(249cM)、191家系(247cM)、192家系(185cM);DJML有1个QTL,192家系(59cM);CFM在190家系中检测到1个QTL(0.0cM);DMC和DXD在同一个家系的同一个位点检测到了1个QTL,187家系(66.1cM)。
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