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毛颚动物门(Phylum Chaetognatha)是海洋无脊椎动物中结构特殊、分类地位尚不明确的一个类群。全球毛颚类种数达144种，中国海域有41种。毛颚类为典型的肉食性动物，其分布受到水团和饵料的影响。毛颚类是海洋生态系统物质循环和能量流动的重要环节。海湾生态系统位于海陆作用较为剧烈的水域，且受人类活动影响较大。目前世界上对于低纬度海湾毛颚类的关注相对较少，而我国南海北部沿岸的海湾，受沿岸经济发展的影响，人类活动对于海湾生态系统的压力也日益增大，富营养愈加严重。本论文对我国典型的热带、亚热带海湾-三亚湾和大亚湾毛颚类种类组成、丰度分布和生物量及生产力的季节变化进行了分析，主要从以下四方面进行研究:(1)两个海湾毛颚类种类组成;(2)两个海湾毛颚类丰度的季节变化;(3)两个海湾毛颚类优势种肥胖软箭虫的次级生产力季节变化;(4)两个海湾毛颚类异同的比较及其原因分析。通过以上研究，以期对海湾生态系统的深入研究提供基础。主要研究结果如下: 1.大亚湾水温季节变化明显:15.71±0.85℃（冬季）-31.12±1.04℃（夏季）。而三亚湾水温除了冬季明显下降外其它季节间相差不大。三亚湾盐度(33.52±1.59)高于大亚湾(31.69±1.67)，这主要是三亚湾受到外海水影响较大，而大亚湾受沿岸流的影响较大。大亚湾叶绿素a全年均值为2.09±2.89mg·m-3，略低于三亚湾(2.43±2.41 mg·m-3)。大亚湾叶绿素a季节变化为春季(4.33±4.88 mg·m-3)＞秋季(1.45±1.00 mg·m-3)＞夏季(1.33±1.27 mg·m-3)＞冬季(1.25±0.99 mg·m-3)，而三亚湾的变化趋势是秋季(4.63±3.36 mg·m-3)＞夏季(2.62±0.46 mg·m-3)＞冬季(1.67±2.01 mg·m-3)＞春季(0.78±0.55mg·m-3)。大亚湾毛颚类主要食物来源的丰度明显高于三亚湾。大亚湾枝角类和桡足类丰度年均值为4300.55±8520.39 ind·m-3和11754.05±14905.38ind·m-3，而三亚湾对应值为126.09±454.13 ind· m-3和4806.37±8581.09ind·m-3。 2.大亚湾毛颚类的群落组成较为简单，出现5种，其中肥胖软箭虫（Flaccisagittaenflata）为四个季节共同的优势种。年平均丰度为18.04±24.34 ind·m-3，春、夏、秋、冬季毛颚类丰度分别为17.44±22.87 ind·m-3、44.38±30.23 ind·m-3、8.45±7.88 ind·m-3、3.63±2.48 ind·m-3。三亚湾毛颚类种类比大亚湾多，共采集到10种。将所采集到的毛颚类进行了生态分类:暖水近岸种、广盐暖水种和外海暖水种。其中广布种肥胖软箭虫为主要优势种。三亚湾毛颚类年平均丰度为48.14±43.59 ind·m-3，春、夏、秋、冬季丰度分别为66.28±65.30 ind·m-3、74.43±34.19 ind·m-3、31.82±18.98 ind· m-3、20.01±7.74 ind·m-3。 3.大亚湾肥胖软箭虫生物量和生产力低于三亚湾。大亚湾海域肥胖软箭虫在春、夏、秋、冬季的生物量分别为0.54±1.34 mg·m-3，1.45±2.95 mg·m-3，0.50±0.63mg·m-3，0.40±0.44 mg·m-3;次级生产力分别为0.27±0.52 mg C·m-2·d-1，0.88±1.87 mg C·m-2· d-1,0.13±0.14 mg C·m-2· d-1,0.05±0.06 mg C·m-2· d-1;而在三业湾肥胖软箭虫的生产量春、夏、秋和冬季分别为1.29±0.91mg·m-3，1.08±0.97 mg·m-3，2.46±3.22 mg·m-3，0.80±0.48 mg·m-3，而其生产力分别为0.97±0.56 mg C·m-2· d-1,0.72±0.49 mg C·m-2· d-1,1.35±1.70 mgC· m-2· d-1,0.32±0.26 mgC·m-2· d-1。 4.毛颚类的分布受到环境因子、食物和海流的影响。三亚湾毛颚类丰度和肥胖软箭虫次级生产力均高于大亚湾，这不仅与三亚湾水温较高相关，同时还与其食物丰度较高的同时也较稳定。与前人研究进行比较，在我国的近岸海湾，毛颚类种类数随着纬度的增高而减少;肥胖软箭虫生产力在南海北部达到最高值而向南向北减少。这与肥胖软箭虫相对适应高温的生态习性和该海区食物较充足有关。