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研究背景:布加综合征(Budd Chiari syndrome, BCS)是血管外科的疑难病,也是我国血管外科的常见病,其自然预后较差,出现症状后的5年生存率很低,非手术治疗死亡率高。因缺乏早期特异性临床表现和有效的早期检测手段,患者就诊时多已属晚期,严重影响其治疗效果,愈后常欠佳,故如何提高BCS的早期诊断率是提高患者生存与预后的关键问题。BCS的病因和发生机制尚不明确,目前国内外对 BCS研究主要集中于肝静脉型,对下腔静脉隔膜型(membranous obstruction of the inferior vena cava, MOVC)的研究较少。本课题以MOVC患者为研究对象,在国内首次以外周血检测作为切入点,应用基因芯片技术比较MOVC患者与正常人外周血单个核细胞的基因表达,筛选出患者与正常人外周血单个核细胞的差异基因表达谱,旨在较全面了解MOVC疾病过程中基因的表达情况,深入研究其相关基因的生物功能,以期能发现早期诊断MOVC和判断其预后的标志基因,并为发现早期筛查的血液标志物做初步探讨。 研究目的:本文利用Affymetrix公司的基因表达谱芯片对MOVC患者和正常人外周血单个核细胞的表达谱进行研究,筛选MOVC相关基因,并对这些基因的功能进行初步的分析,为MOVC的临床诊断和治疗提供新的途径。 研究方法患病组和正常对照组各3例。将每个血液样本单独抽提总 RNA,鉴定其质量,纯化后使用生物素标记,制成 RNA探针,通过与包括全转录本的Affymetrix Human Gene1.0 ST Array表达谱芯片杂交,杂交后的芯片用激光扫描仪进行扫描,经过信号检测、微阵列图像分析、计算机软件数据处理,将所得的数据进行比较,得出两组基因的表达信息,用t检验筛选患者外周血和正常对照组外周血单核细胞的差异表达基因(以P<0.05为条件),根据 Gene Ontology对所筛选的部分差异基因进行功能分析。 研究结果:经过分析,以p<0.05作为标准,得到1,609个差异表达的基因。以p<0.05且Fold change值>2为标准,得到100个显著差异基因,其中有54(54%)差异表达基因为上调基因,46(46%)基因为下调基因。以p<0.01作为标准,得到303个差异表达的基因。以p<0.01且Fold change值>2为标准,得到25个极显著差异基因,其中有8个(32%)差异表达基因为上调基因,17个(68%)基因为下调基因。在对极显著差异基因进行功能分析时,我们发现有13个差异基因无功能注释,也主要存在于表达下调的基因中,表达上调的8个基因部分有功能注释,主要涉及免疫,细胞信号转导,炎症反应,凝血,血管生成抑制,细胞周期相关等方面,功能亦十分复杂。 研究结论:应用基因芯片技术能筛选出MOVC型BCS和正常人外周血单个核细胞差异表达的基因,并能探讨部分差异基因的生物功能。从基因角度研究 MOVC,为进一步深入研究布加综合征的发病机制提供依据并奠定分子生物学基础。这些差异基因可能有助于发现MOVC早期筛查的血液标志物的研究。基因芯片技术作为一种新兴的生物学技术,具有大规模、高通量、高效率的特点,能高效筛选差异表达基因。通过DNA芯片,可从全局角度了解MOVC基因的表达情况,为筛选MOVC相关基因及基因治疗研究方面提供了强有力的工具。