猪7号染色体q1.1-1.4区域脂肪性状QTL的遗传分析

来源 :华中农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:ganmaogaishilangren
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多项研究表明猪7号染色体p1.1-q1.4区域上存在显著影响背膘厚等脂肪沉积性状的QTL。在本室组建的大白×梅山猪F2代资源家系前期研究也表明该区域存在显著影响背膘厚性状的QTL,该QTL位置在p1.1-q1.4区域的Sw1856-Sw859标记区域内。本研究借助已公布的猪基因组序列图选定了猪7号染色体上该基因组区域10个位置候选基因,利用比较测序方法筛选了位于这些基因内部的部分SNP,进行了连锁图谱构建和QTL定位研究,具体结果如下:1.选择了位于Sw1856-Sw859区域内的6个候选基因,在这些基因内部发现了22个新SNP标记,并建立了其中6个新分子标记的基因型检测方法。综合利用已报道的4个SNP标记,在20Mbp的范围内共选用了10个SNP标记,对315头大梅F2个体进行基因型判定;选择8个多态信息含量丰富的SNP标记(多态信息含量为0.359~0.375)构建了连锁图谱。所构建的连锁图谱全长为24.6cM,位点间的平均距离为3.51cM。2.结合构建的SNP遗传连锁图谱,用线性模型最小二乘法对7个脂肪沉积相关性状进行QTL区间作图,利用置换法(permutation)确定显著性阈值。在脂肪性状的QTL定位分析中,共有5个QTL达到染色体显著水平(P<0.05),其中4个达到染色体极显著水平(P<0.01)。①在GNMT-PLA2G7区间内检测到了影响胸腰结合处背膘厚QTL的存在,最大F值位于遗传图谱23cM处,该QTL解释了5.207%的表型变异,来源于大白品种的等位基因具有增加胸腰结合处背膘厚的效应。②在PPARD-GLP1R区间检测到了显著影响板油重、臀部平均背膘厚、三点平均背膘厚和6-7胸椎背膘厚QTL的存在,4个QTL分别解释了4.575%、4.999%、3.975%和4.668%的表型变异,来源于大白品种的等位基因分别表现为增加板油重、臀部平均背膘厚、三点平均背膘厚和6-7胸椎背膘厚的效应,最大F值位于遗传图谱11-12cM处。
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