盘羊×欧拉羊F1代的肉品质及UCP家族基因多态性与欧拉羊生长性状关联分析

来源 :西北民族大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:star2006111
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本研究以盘羊与欧拉羊杂交后代(以下简称盘欧杂交F1)和欧拉羊为研究对象,进行屠宰性能测定及肉品质比较分析,并选取与动物生长发育相关的解偶联蛋白(Uncoupling protein)家族中的UCP2和UCP3作为欧拉羊生长发育的候选基因,采用RT-PCR技术对UCP2、UCP3基因CDS区进行扩增和克隆,对克隆所得产物测序并对其特征进行生物信息学分析。采用PCR产物直接测序检测了UCP2和UCP3基因的遗传多态性及其与欧拉羊的生长性状进行关联分析。本研究的主要研究结果如下:1.在屠宰性能方面,盘欧杂交F1的宰前活重显著高于欧拉羊(P<0.05),在胴体重、屠宰率、眼肌面积等指标差异不显著(P>0.05);在肉品质方面,欧拉羊的失水率显著高于盘欧杂交F1(P<0.05)其余各肉品质指标则差异不显著(P>0.05);在氨基酸含量上,组氨酸和半胱氨酸含量差异显著(P<0.05),其余氨基酸含量两者差异不显著(P>0.05);在脂肪酸含量上,盘欧杂交F1的单不饱和脂肪酸和多不饱和脂肪酸含量均高于欧拉羊(P>0.05);在风味成分测定上,两者检测均发现34种风味物质,风味组成成分相似且含量差异小。2.盘欧杂交F1的UCP2基因CDS区长931 bp,共有7个开放阅读框,编码309个氨基酸;UCP3基因CDS区长937 bp,共有5个开放阅读框,编码244个氨基酸。盘欧杂交F1的UCP2蛋白理论等电点为9.64,不稳定指数为36.27,半衰期为30 h,总平均亲水性为0.109,为稳定蛋白且表现疏水性;盘欧杂交F1的UCP3蛋白理论等电点为9.25,不稳定指数为44.80,半衰期为30 h,总平均亲水性为-0.034,为不稳定蛋白且表现亲水性。UCP2、UCP3都属于非分泌蛋白且无信号肽。UCP2、UCP3都不具有跨膜螺旋结构;UCP2存在26处磷酸化修饰位点,UCP3存在23处磷酸化修饰位点。UCP2、UCP3蛋白二级结构组成均以α-螺旋为主。同时,通过亚细胞定位发现UCP2、UCP3蛋白均主要存在于细胞质内。3.在欧拉羊UCP2基因上筛选出2个SNPs位点,分别为g.52130414 C>T和g.52130584 G>A,其中g.52130414 C>T位点产生TT、CT和CC 3种基因型,g.52130584 G>A位点产生AA、AG和GG 3种基因型;在欧拉羊UCP3基因上筛选出1个SNP位点g.52157335 C>T,其产生CC、CT和TT 3种基因型。基因多态性分析表明,3个SNPs位点均为错义突变位点,属于中度多态,且均符合Hardy-Weinberg平衡适应性检验(P>0.05)。4.基因多态性与欧拉羊生长性状的关联分析结果显示,UCP2基因g.52130414 C>T位点TT基因型欧拉羊体重显著高于CT基因型(P<0.05);g.52130584 G>A位点AA基因型欧拉羊体重和体斜长均极显著高于AG和GG基因型(P<0.01),AA和GG基因型欧拉羊胸围均显著高于AG基因型(P<0.05);UCP3基因g.52157335 C>T位点CC基因型欧拉羊体重显著高于CT基因型(P<0.05),TT基因型欧拉羊胸围显著高于CT基因型(P<0.05)。3个多态位点基因型组合分析发现,D5型欧拉羊体重极显著高于D1、D2、D3型(P<0.01);D5型体高显著高于D3型(P<0.05);D5型体斜长极显著高于D2型(P<0.01),显著高于D1、D3、D4型(P<0.05);各双倍型间胸围均无显著差异(P>0.05)。本研究对盘羊与欧拉羊杂交后代的杂交效果进行评价为了解及掌握其生长发育情况提供一定的数据基础。对UCP2、UCP3基因进行生物信息学分析,可为今后探索UCP2、UCP3蛋白生理功能可提供一定的科学基础和依据。将UCP2、UCP3基因作为影响生长性状的候选遗传标记用于育种辅助选择,为后续欧拉羊的分子育种提供科学依据。
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