LncRNA-H13在小鼠胚期表达谱研究及其功能初探

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Lnc RNA是指长度大于200bp的无蛋白编码能力的RNA分子,与编码基因有着相似的结构,且存在着转录后的剪接现象。Lnc RNA的时空特异性表达说明此类RNA与多种生命活动相关,并且其功能往往通过调控其他已知基因的表达来实现,目前主要通过基因敲除或过表达研究Lnc RNA的功能。本课题基于RNA-seq数据预测的与小鼠胚胎生长发育相关的长非编码RNA,并对其存在进行初步的验证分析,然后选取表达量相对较高的Lnc-H13作为最终研究对象。Lnc-H13位于小鼠2号染色体上,生物信息学预测全长7122bp,只含有一个外显子区。Hic数据表明,Lnc-H13作用于Mcts2和H13。因此,本课题分析了Lnc-H13基因在小鼠胚期的表达模式并对其功能进行了初步的探究。首先,采用q RT-PCR及原位杂交技术分析了Lnc-H13在小鼠胚胎时期的定量及定位情况。结果显示,在全胚胎中Lnc-H13的表达水平随着胚胎的发育逐渐升高,并在E15.5天达到表达量的峰值。E10.5天全胚胎原位杂交结果显示,Lnc-H13对胚胎发育早期的神经系统的形成有着紧密的联系,E12.5天胚胎切片原位杂交显示Lnc-H13表达于脑组织和肺脏中。随着胚胎发育至中期,Lnc-H13广泛表达于脑、舌、心、肺、肾等重要组织器官。基于Lnc-H13持续高表达于脑组织这一结果,我们对胚胎时期小鼠脑不同发育阶段中Lnc-H13的表达进行了定量分析,结果显示,随着胚胎的发育Lnc-H13在脑中的表达量呈现先升高后降低的形式,并在小鼠出生前有了轻微的波动,基于此现象,我们对在出生后小鼠脑中的定位情况进行了分析,结果显示,Lnc-H13基因普遍表达于P0、P10和P30脑组织中的嗅球和小脑部位。综合上述结果,我们可以得出结论:Lnc-H13基因参与了小鼠胚胎的发育过程,并且对神经系统功能的发育有着重要的作用。最后,在NIH3T3细胞中我们采用CRISPR/Cas9技术敲除Lnc-H13基因后,检测到当Lnc-H13基因显著下调时,靶基因表达水平没有发生统计学意义上的变化。综上所述,本研究分析了Lnc-H13基因在小鼠胚胎中的表达情况并对Lnc-H13在小鼠出生后脑中的定位和调控功能进行了初步的探究。
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