2013年以来，新疆境内、境外（北京金水桥恐怖袭击事件、昆明3.01恐怖事件）发生了一系列暴力恐怖事件，这些暴力恐怖事件严重影响了社会稳定，给人民群众的生命财产安全造成了极大损失。探究这些暴力恐怖事件的根源，都和宗教极端主义有着千丝万缕的联系。正如新疆自治区人民政府主席努尔白克力所说过，几乎所有的暴力恐怖活动都是从非法宗教活动开始的，非法宗教活动是宗教极端思想的根源，是暴力恐怖活动的温床。新疆自古以来就是多种宗教的集散地，宗教历史悠久、宗教氛围浓厚。宗教思想总是有形无形的影响着广大青少年、特别是大学生的思想观念，成为影响南疆社会稳定的重要因素。做好抵制极端宗教思想渗透，在大学校园坚决抵制宗教思想渗透显得尤为重要。近期，自治区教育厅在全疆高校范围内开展抵制“三非”、去宗教极端化活动，此举表明教育厅坚决抵制宗教思想对高校大学生的渗透的力度和决心，也是确保新疆社会稳定，长治久安的有力措施。本文首先阐述了宗教和教育的联系，分析了教育、宗教的本质和内涵及在历史发展过程中两者之间的联系，结合我国《宪法》及《教育法》等法律、法规提出我国坚持教育与宗教相分离的实施依据。其次概括分析了宗教思想向南疆高校渗透的方式及特点。宗教思想向南疆高校渗透的方式主要有四个方面：一是利用大学讲坛，公开宣传宗教教义；二是利用与大学生交友和资助贫困生；三是利用新兴媒体；四是流行、时尚服饰。渗透呈现出三个特点：一是宗教渗透的政治性；二是宗教渗透的隐蔽性；三是宗教渗透的地域特殊性。再次本文陈述了宗教渗透对南疆社会（跨越式发展和长治久安两个方面的危害）其中包括经济、社会安定、民族团结等方面的危害，特别是对大学校园的危害包括三个方面，一是对马克思主义意识形态的挑战；二是对少数民族大学生“四个认同”教育的挑战；三是对高校科学文化传播和校园文化创新的挑战。以上这些危害让我们更加认清宗教、特别是极端宗教的本质，让大学生远离宗教，从而远离极端宗教。最后文章提出了抵御和防范宗教向南疆高校渗透的对策，主要包括以下几方面：一是引导学生、教职工正确认识、理解和把握马克思主义宗教观，积极引导宗教与社会主义相适应，让宗教远离高校校园；二是充分发挥高校党委宣传部的舆论宣传、引导作用，发挥高校思想政治理论课的作用，规范高校各项制度及抓好高校关键节点的管控；三是充分发挥大学生中党员的带头作用；四是加强高校大学生校园文化创新能力培养，希望通过这些，更好的抵制和防范宗教向南疆高校校园渗透。