烟草花叶病毒全长基因组克隆与分析及受其侵染的番茄叶片酵母双杂交cDNA文库构建

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烟草花叶病毒(Tobacco mosaic virus,TMV)是侵染番茄(Solanum lycopersicum)的主要病毒之一。TMV与番茄相互作用研究对于阐明TMV在番茄中的致病机制,及其所致病害防治策略的提出均具有重要的意义。酵母双杂交技术是研究蛋白相互作用的有效手段之一,本研究获得了 TMV贺州分离物全长基因组克隆,构建了受该病毒侵染以及健康番茄叶片的酵母双杂交cDNA文库,为今后进行TMV与番茄相互作用研究提供了重要的物质基础。TMV贺州分离物基因组全长6395 nts,包含68 nts的5’端UTR和207 nts的3’端UTR,编码126kDa蛋白、54kDa(蛋白)、由126 kDa蛋白通读产生的183 kDa蛋白、运动蛋白和外壳蛋白共5个ORF。运动蛋白ORF与183 kDa蛋白ORF有14个碱基发生重叠。该分离物的核苷酸序列与GenBank登录号为AF395129.1的TMV-152相似性最高,达到99%。受TMV侵染番茄叶片酵母双杂交cDNA文库的容量为1.54X 106 CFU,重组率100%。文库分成0.5~1 kb、1~2 kb和大于2 kb 3个亚库构建,容量分别为4.2×105、7.7×105和3.5×105CFU,插入片段平均长度分别为0.68、1.21和2.33 kb。健康番茄叶片酵母双杂交cDNA文库的容量为1.62X 106 CFU,重组率100%,同样分为0.5~1 kb、1~2kb和大于2kb3个亚库构建,容量依次为4.7×105、7.8×105和3.7×105CFFU,插入片段平均长度依次为0.77、1.35和2.381 kb。本研究构建的两个酵母双杂交cDNA文库,都具有较大的库容量,插入片段的平均长度以及重组率则达到了很高的水平,说明文库质量较高,可以用于筛选番茄中与TMV编码蛋白相互作用的蛋白,也可以用于番茄编码蛋白相互作用研究,为今后研究TMV与番茄相互作用机制,以及特定番茄基因的功能奠定了良好的基础。
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