【摘 要】
:
目的:长链非编码RNA(lncRNA)是一类长度大于200 nt的非编码RNA分子,在多种层面调控基因的表达,涉及到各个系统的多种器官,广泛参与机体的生理和病理过程。近年的研究相继发现
论文部分内容阅读
目的:长链非编码RNA(lncRNA)是一类长度大于200 nt的非编码RNA分子,在多种层面调控基因的表达,涉及到各个系统的多种器官,广泛参与机体的生理和病理过程。近年的研究相继发现了一些在肿瘤组织中异常表达的lncRNA,且以lncRNA上调者为多见。但绝大多数lncRNA的功能及作用机制尚不明确。本实验室前期研究表明RSU1P2在宫颈癌组织中高表达,提示其可能发挥癌基因作用。本课题从探寻lncRNA RSU1P2的功能出发,阐明其在宫颈癌细胞中的作用及具体机制,并初步探究其异常表达的调控机制,这将为宫颈癌发生发展的分子机制提供新的理论基础,也为宫颈癌的诊断和治疗提供新的线索。方法:首先,在人宫颈癌HeLa和C33A细胞中过表达或敲降RSU1P2后,分别应用MTT实验、平板克隆形成实验、Transwell细胞迁移侵袭实验、血管拟态形成实验检测RSU1P2对宫颈癌细胞恶性表型的影响,并利用流式细胞术和Western blot实验分别检测RSU1P2对宫颈癌细胞的细胞周期和上皮间质转化(EMT)的影响;其次,利用生物信息学方法预测可能靶定RSU1P2的候选microRNA(miRNA),并利用荧光报告载体实验结合qRT-PCR技术验证let-7a对RSU1P2的直接调控作用;然后通过生物信息学方法并参考文献报道,筛选let-7a下游可能的靶基因,并利用荧光报告载体实验结合qRT-PCR和Western blot技术验证let-7a对其靶基因的直接调控作用及其可能的调控方式;接下来在HeLa细胞中过表达或敲降RSU1P2后,应用qRT-PCR和Western blot技术验证RSU1P2对let-7a的下游靶基因的竞争性调控作用,并利用qRT-PCR技术检测在RSU1P2高表达的14对宫颈癌及其癌旁组织中let-7a及其靶基因的表达水平;而后,利用荧光报告载体实验检测RSU1P2是否以miRNA依赖的途径对靶基因进行调控;最后,采用生物信息学方法预测RSU1P2上游存在可能的启动子区域,同时结合转录因子预测软件预测可能与之结合的潜在转录因子,通过qRT-PCR技术检测改变MYCN的水平对RSU1P2及let-7a表达水平的影响。结果:细胞功能学实验表明RSU1P2能够促进宫颈癌细胞HeLa和C33A的细胞活性、生长、诱导细胞周期G1/S期转化,促进EMT、细胞侵袭和转移,以及血管拟态形成从而发挥促癌基因的作用;生物信息学预测发现RSU1P2转录本具有多个miRNA的潜在结合位点,荧光报告载体实验和qRT-PCR技术验证let-7a直接靶定并负性调控RSU1P2;筛选并证实了 let-7a发挥作用的下游靶基因IGF1R、MYCN、EphA4 及 C14orf28;在 HeLa 细胞中,RSU1P2 能够促进基因IGF1R、MYCN、EphA4及C14orf28的表达,并与内源性let-7a的表达水平呈负相关,同时临床标本分析验证了这一调控关系;RSU1P2通过miRNA依赖的途径对靶基因进行调控;初步分析潜在转录因子MYCN对RSU1P2具有转录调控作用,并影响let-7a的表达。结论:lncRNA RSU1P2可以促进宫颈癌细胞的恶性表型,并通过与let-7a的靶基因IGF1R、MYCN、EphA4及C14orf28竞争性结合let-7a,作为竞争性内源RNA(competitive endogenous RNA,ceRNA)发挥作用。转录因子 MYCN 与RSU1P2形成正反馈环路,进而增强其癌基因的功能。
其他文献
太阳能被认为是最有潜力的可再生能源,随着人们对于太阳能的不断研究和理解,太阳能电池也得到了相应的发展,从最早的硅电池,到多元化合物薄膜电池,再到最新的第三代太阳能电
支持向量机(Support Vector Machines,SVM)是基于统计学习理论的一种新的学习方法。然而,有一类支持向量机的泛化能力在很大程度上取决于核函数的选择。根据目前支持向量机的研究现状,发现引入智能优化算法对支持向量机参数进行优化有一定的局限性。例如,一些智能优化算法在优化时过于依赖参数的控制,控制参数的变化对支持向量机的分类和识别有很大的影响。本文首先对支持向量机进行了研究,发现由
目的:研究谷胱甘肽过氧化物酶2(Glutathione peroxidase 2,GPX2)在宫颈癌组织和细胞中的表达情况以及GPX2与宫颈癌临床病理特征的相关性。利用分子生物学技术探讨GPX2与活性
目的:随着癌症诊断治疗相关研究的深入,肿瘤酶在肿瘤发生发展与治疗诊断中的地位愈发重要。肿瘤酶具有特异性表达于肿瘤组织的普遍特征,如基质金属蛋白酶2在多种肿瘤的表达量
随着科技的进步,在许多领域例如计算生物,物流配送中的车辆调度,采矿,以及当下热门的大数据与人工智能领域等,很多实际应用模型都涉及到大规模优化问题的求解。在这类问题的求解上,一些传统的优化算法比如牛顿法,拟牛顿法,共轭梯度法等经典方法不再那么高效甚至是无效的。故而这类问题的求解是相当困难且具有现实研究意义的。求解这类的问题困难之处主要在于以下几点:一个是搜索空间巨大,目前的算法搜索效率较低,很难在给
人工神经网络是一种以生物神经系统为数学模型获得非线性处理数据能力的自适应系统,其在模式识别、预测估计、自动控制等领域成功地解决了很多计算机无法完成的实际问题。常见的人工神经网络包括BP神经网络、径向基神经网络、卷积神经网络等。其中,BP神经网络拓扑结构相对简单,理论及应用发展迅速,逐渐成为研究的热点。传统的BP神经网络学习算法是采用梯度下降的原理,对误差由后向前传递,计算各神经单元输出值与期望值的
中国的官员考核制度自2003年以来发生质的变化,在注重经济增长的同时,也强调环境污染治理、城镇人均可支配收入等多个层面的并行发展。较之于其他类型的城市,中国资源枯竭型城市在转型过程中环境污染、产业结构调整等问题更为严峻,在处理这些问题的过程中,地方官员,尤其是地方一把手的作用尤为重要,其对于政绩的诉求可能在一定程度上影响资源枯竭型城市的转型效率。基于此,首先对美国、德国、中国与日本资源枯竭型城市转
本研究在连续流合建式反应器内接种具有厌氧氨氧化功能的污泥,以实际猪场沼液作为进水,通过改变工艺参数的方式启动CANON(Completely autotrophic nitrogen removal over nitrite)工艺,并考察了水力停留时间(HRT)、温度和进水氨氮浓度对CANON工艺处理猪场沼液脱氮性能的影响,并在此基础上采用响应曲面法优化反应器脱氮性能;利用高通量测序技术对污泥样品
随着中国社会经济的高速发展,我国汽车保有量逐年提升。在成人社交环境必不可少的饮酒文化、交通部门严厉打击酒驾及全民安全意识提升等多重因素的影响下,直接促生出了代驾的刚性需求,随之而来的是代驾从业人员的急剧增加。深入调研之后,我们发现代驾行业存在以下特点:1、酒后使用场景80%以上,要求司机具有较高的综合素养和紧急情况处理能力;2、代驾司机普遍文化文平较低,服务意识较差;3、司机流失率较高。但对整个社
渤海BZ地区发现的大型凝析气田属一种深层潜山变质岩裂缝型油气藏,该区域受印支、燕山两期关键构造运动形成北西、北东两组断裂系统,控制了太古界潜山主要构造样式发育,潜山顶界面及内幕构造类型复杂多样,楔冲构造、双冲构造、断陷构造相互作用,断裂裂缝系统呈现立体网状。潜山储层埋藏较深且非均质性强、岩性横向变化快、地层破坏程度高,目标区域地震资料品质较差,为地震储层预测技术带来许多挑战。本文是基于渤海BZ地区