随着微生物基因组测序计划的快速发展,大量微生物基因组序列已被测定。分析基因结构,挖掘序列所包含的生物学信息,提取特征参量,设计识别算法,识别基因,对基因组进行注释是生物信息学的重要课题。本论文的主要任务是分析原核生物基因翻译起始位点附近序列特征、设计参量、建立算法,识别原核生物基因翻译起始位点,该算法可应用于原核生物基因组注释。本文的内容由五部分组成:第一章介绍生物信息学的发展背景和主要的研究内容以及本文的研究成果和创新点。第二章介绍与本论文原核生物基因翻译起始位点识别相关的一些生物学和数学知识,以及本文用到的一些软件。第三章是本论文的主要工作,介绍识别原核生物基因翻译起始位点的特征参量、识别过程以及识别结果。本论文提出的微生物基因翻译起始点识别算法是在将原核生物基因分为信号肽基因和非信号肽基因的基础上,引入RNA最小折叠自由能特征参量,结合其他特征参量,训练识别算法,采用协同扫描模型,识别信号肽基因和非信号肽基因翻译起始点。识别结果不仅在长基因方面具有很高的精度,而且在识别短基因方面同样非常优异。此外,还与其它同类识别算法进行了比较。第四章对识别原核基因翻译起始位点的识别结果,系统分析与深入讨论。第五章是文章的结论部分,首先对上述工作进行简单概述总结,然后讨论了基因识别领域一些尚未完全解决的问题,最后提出本文主要的三个创新点。