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转录因子JunD在肝癌发生以及发展中的作用已被报道。本研究的侧重点在于影响JunD结合的功能性遗传变异的系统挖掘，提供了完整而可靠的研究方法。首先从全基因组范围内的ChIP-chip数据出发，在84032个候选SNP中严格筛选到39个位于JunD结合的保守序列中并且在中国人群中突变频率大于百分之5的SNP，即最有潜力影响JunD结合的SNP，理论上不会遗漏任何有意义的SNP，使假阴性率最小化。而后通过大样本量的病例-对照研究，考察上述SNP与肝癌易感性的关联，统计结果显示rs4951541、rs2232965、rs281230、rs7820850这四个SNP p值小于0.05，即表示这些SNP与肝癌的发生有显著关联，另外计算优势比(OR)及其95％置信区间，显示rs4951541A＞C多态性为肝癌的风险型突变，rs4951541CC基因型的个体发生肝癌的概率是rs4951541AA基因型的个体的1.453倍;rs2232965C＞T多态性为肝癌的风险型突变，rs2232965TT基因型的个体发生肝癌的概率是rs2232965CC基因型的个体的2.371倍;rs281230G＞A多态性为肝癌的保护型突变，rs281230AA基因型的个体发生肝癌的概率是rs281230GG基因型的个体的0.577倍;rs7820850C＞T多态性为肝癌的保护型突变，rs7820850TT和TC基因型的个体发生肝癌的概率是rs7820850CC基因型的个体的0.683倍。这四个与肝癌易感性有显著关联的功能性SNP，极有可能是通过影响JunD结合而发挥作用的。 接下来在组织样本中探索这四个SNP经由JunD介导调控的下游靶基因，发现在正常组织中rs7820850基因型与PVT1表达量最有可能有关联，所以将rs7820850作为下一步深入研究机制的对象。然后通过电泳迁移率变动分析实验在三种细胞系中证实JunD与rs7820850C基因型结合比与T基因型结合强得多。由于rs7820850位于c-Myc与PVT1之间基因沙漠区域，所以通过染色体捕获构象技术考察rs7820850的远距离相互作用，发现与rs7820850与mir-1205转录起始位点之间存在临近的相互作用。 综上，本研究发现了数个与肝癌易感性有显著关联的功能性遗传变异，并详细研究了rs7820850的作用机制，它们或可成为新型生物标志物，为肝癌的诊断和个性化治疗提供新策略。