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研究背景SLN是原发肿瘤发生淋巴结转移所必经的第一站淋巴结。乳腺癌SLNB能准确预测腋窝NSLN的状态。当SLNB结果为阴性时,患者不需行ALND。现有的术中冰冻切片假阴性率高,而通过分子生物学方法检测乳腺上皮特异基因的表达来判断SLN中是否有乳腺癌细胞的转移则具有整体、客观、准确和快速等优势。本课题组前期建立了乳腺癌SLN分子病理检测技术,能够在术中快速识别SLN状态,为乳腺外科医师进行下一步手术策略提供帮助,不过其敏感性及特异性有待进一步大样本验证。对于SLNB阳性的患者,通常需要行ALND,来控制肿瘤细胞的转移。但其中约40~70%患者腋窝NSLN并没有转移,对这部分乳腺癌患者不必要行ALND,还可以避免其所带来的一系列术后并发症。因此辨别何种SLN阳性乳腺癌有很低的腋窝转移风险而不需行ALND是非常有必要的。不过现有的预测模型及分子标志物仍比较局限并且其实用价值有待于进一步的研究,本研究通过对乳腺癌阳性SLN进行转录组测序,探索预测NSLN转移状态的分子标志物,也许能使一些阳性SLN乳腺癌患者免于行ALND。目的验证本课题组前期建立的乳腺癌SLN术中快速分子病理检测技术的可靠性。通过转录组分析,全面的探索和寻找能够预测乳腺癌SLN阳性患者腋窝转移状态的分子标志物。方法本研究入组的所有病例符合以下标准:①术前病理学证实为乳腺癌;②临床及影像学检查提示腋窝淋巴结阴性;③肿瘤细胞无远处转移;④术前未进行过化疗、内分泌治疗及放疗。收集北京市7家三甲医院的134例乳腺癌SLN样本,分别应用RT-LAMP法和经过美国FDA批准的Gene Search技术检测乳腺癌患者的SLN,对比两种检测方法的一致性。收集解放军307医院2010年11月至2013年4月SLNB阳性伴或者不伴腋窝淋巴结转移的患者,应用第二代高通量Illumina Hiseq 2000基因组平台测序分析阳性SLN中肿瘤细胞的差异表达基因和融合基因。结果以Gene Search技术为金标准,RT-LAMP方法的敏感性为96.2%(25/26),特异性为96.3%(104/108),两种方法的一致率为96.3%(129/134),统计学一致性分析Kappa=0.8857,P<0.001。从305例乳腺癌患者中筛选出SLN阳性的患者6例(所有患者ER/PR+,HER2-,Ki67<20%),平均划分为NSLN阴性组和阳性组。在NSLN阳性组和阴性组分别发现103和47个差异表达基因。其中,FABP1(阳性组)和CYP2A13(阴性组)是唯一的两个编码蛋白并且表达水平较高的基因。与此同时,在FDR<0.05的水平下,NSLN阳性组发现了62个上调基因(主要富集在KLK基因家族)和98个下调基因(主要富集在B细胞信号受体通路上)。另外还发现了10个不同的融合基因,在NSLN阳性组中最频繁发生融合的基因为IGLL5,预示着在淋巴转移过程中发挥着重要作用。结论本课题组前期建立的RT-LAMP方法与Gene Search技术相比有较高的一致性,并且具有快速、便捷、低成本等特点,在乳腺癌SLN术中转移检测方面具有良好的应用前景。本研究首次通过对乳腺癌阳性SLN进行转录组测序来探索预测腋窝淋巴结转移状态的分子标志物。研究中筛选出的差异表达基因及融合基因可能对腋窝NSLN转移方面具有提示作用。