当前我国把自主创新作为经济结构调整与提高国家竞争力的中心环节,这是指导我国全面建设小康社会、走新型工业化道路的指针。作为自主创新的组成部分,原始创新、集成创新和引进、吸收再创新是一个统一的有机体,互相作用,互相促进。坚持自主创新,一是要加强原始性创新,努力获得更多的科学发现和技术发明;二是要加强集成创新,通过各种相关技术成果的融合汇聚,形成具有市场竞争力的产品和产业;三是要在广泛吸收全球科学成果、积极引进国外先进技术的基础上,充分进行消化吸收和再创新。提高自主创新能力,建设创新型国家是我国当前科技工作的重要任务,也是一项系统工程。提高自主创新能力涉及企业、高等院校、科研机构和社会中介组织以及各级政府,是在引进技术消化吸收再创新、集成创新和原始创新三个层面上创新能力此消彼涨的演化过程,因此,以提高自主创新能力为核心的国家自主创新体系建设势在必行。自主创新体系是以获取自主知识产权、掌握核心技术为宗旨,以我为主发展与整合创新资源,进行创新活动,提高创新能力的科技战略方针的创新体系。政府作为自主创新体系中的一个重要主体,在建设自主创新体系中具有举足轻重的作用。政府在行动时正确定位、并在重点工作领域内以适当的工作方式发挥作用非常关键。通过美国、日本和韩国典型创新型国家的创新体系建设比较分析,认为政府在创新体系建设中起到了非常重要的作用,政府通过参与创新,营造环境,技术立国战略等,极大的促进了技术创新。以江苏省作为案例分析,研究江苏省自主创新体系建设的现状、问题和不足,得出江苏省政府应该发挥引导和管理的职能,从体制上、机制上为企业自主创新营造有利环境,实行支持自主创新的财税、金融和政府采购等政策,完善自主创新的激励机制,加大保护知识产权的执法力度,优化创新环境。加快发展创业风险投资,提供发展研究开发和技术发展的公共服务平台,建设自主创新体系。经过国内外的比较和案例的分析,得出我国自主创新体系建设中的问题在于自主创新能力不足,企业没有成为自主创新主体,创新体系整合效率低等。而作为政府,对自主创新认识的落后,科技投入不足和管理体制落后等都是导致我国自主创新能力不高的原因。所以,我国政府必须创造有利于自主创新的体制机制和政策环境,充分发挥企业在自主创新中的主体作用,充分发挥科研院所和高校在自主创新中的中坚作用,把引进技术与提高自主创新能力相结合,建设自主创新体系。