哺乳动物及酵母细胞研究发现，磷脂酰肌醇-3激酶(PI3KC3)在细胞内吞、自噬、液泡蛋白分选等多条胞内运输途径中有关键作用。然而，对PI3KC3在拟南芥中的唯一一个同源基因AtVPS34研究较少，但确定的是AtVPS34具有P13KC3的功能，且AtVPS34敲除致死。基于此，我们通过RNA干扰方法获得了AtVPS34 mRNA表达程度不同的T3、T4代纯合株系。通过一系列表型观察、生理、分子指标测定发现，AtVPS34-RNAi各株系莲座生长速度、黄化苗下胚轴细胞长度均小于野生型，主要归因于AtVPS34-RNAi细胞伸长能力的显著下降与细胞分裂能力的轻微下降。主根伸长、侧根发生及重力响应在AtVPS34-RNAi中均有明显缺陷，而极低浓度的生长素IAA或NAA即能回补这些缺陷。NAA处理后，AtVPS34-RNAi突变体中生长素响应基因的转录本水平显著高于野生型。同时，AtVPS34启动子驱动GUS表达的转基因植物经NAA处理后GUS信号显著提高。指示生长素响应的DR5rev:GFP在突变体根尖及其胚根细胞中定位有所改变，荧光信号在根尖静止中心处变弱，在更多根冠柱状细胞中出现甚至变强。生长素外运蛋白PIN1、PIN2在突变体根中定位明显异常，而磷脂酰肌醇-3激酶抑制剂能在野生型中模拟出同样的PIN定位模式。综上，我们推测AtVPS34可能通过参与调控TIR1-AUX/IAA-ARF生长素响应信号通路及PIN介导的生长素极性运输而调控拟南芥的生长发育。